在作物栽培和城市绿化过程中，由于连年使用化肥，土壤板结，肥效日减，损坏了作物品质，破坏了生态平衡。况且，化肥在制造、储运和使用过程中，连续不断地污染着环境，破坏生态平衡，对人类社会造成了相当严重的危害。化肥被列为农业的三个污染源之一。作为化肥生产原料和能源的石油资源有限，依赖有限资源终难以维持农业的持续发展。
当人们抱怨吃什么东西都没有味道，农民抱怨土地越来越没肥力的时候，才发现大量使用化肥的副作用和农药带来的危害，这才对微生物肥料有了更加深刻的认识：
微生物肥料是活性肥料，它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活动来完成，只有当这些有益微生物处于旺盛的繁殖和新陈代谢的情况下，物质转化和有益代谢产物才能不断形成。因此，微生物肥料中有益微生物的种类、生命活动是否旺盛是其有效性的基础，而不像其它肥料是以氮、磷、钾等主要元素的形式和多少为基础。正因为微生物肥料是活制剂，所以其肥效与活菌数量、强度及周围环境条件密切相关，包括温度、水分、酸碱度、营养条件及原生活在土壤中土著微生物的排斥作用都有一定影响。忽略这些因素，或者把有机肥料当作微生物肥料销售使用，是对微生物肥料认识不足的主要原因。
为什么对微生物肥料认识不足？
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