1.要保持鱼体湿润。如果鱼体干燥，有些症状会变得不明显，甚至根本无法辨认；寄生在鱼体表的病原体，也会很快死去或崩解，无法诊断。因此，用作检查的病鱼不可让它在空气里干燥,应放在水桶里（最好用原池的水），或用湿布包裹。
2.用过的工具要清洗干净后再用。对某一条鱼，甚至同一条鱼的不同器官接触过的用具，要洗干净后才可在另一条鱼或另一个器官上去操作，这是为了避免解剖工具把病原体从一条鱼带到另一条鱼.或从一种器官带到另一种器官上，避免把病原体寄生部位搞错而影响对鱼病的正确诊断。
3.分离出鱼的内部器官，要保持器官的完整和湿润。当把各个器官取出时，要小心操作，不要把器官的外壁弄破,特别是肠、胆囊等,以防内含物和病原体外流，污染其他器官,影响对疾病诊断的正确性。同时，要小心地把器官分离，分放在解剖盘内或其他干净的器皿内，并保持各个器官的湿润。
4.一时无法诊断的疾病要保留标本。在检查过程中，对每个器官要先用肉眼仔细观察，如果发现有病原体，可以用镊子或者解剖针把它分拣出来，放到器皿内，并标明来自于哪一个器官；如果用肉眼无法判定时，可以用镜检；如果镜检仍然无法判定的，应把这部分组织保存起来，以便进一步作病原检查
