随着水产技术推广补助项目的实施，科技入户主推技术的推广，小型水库增养殖放养密度有了一定提高，造成寄生虫、细菌性疾病时有爆发，但由于水库面积大水又深，治疗鱼病相当麻烦，且成本较高。因此，小型水库养殖病害防治应遵循“防重于治”的方针，要注意以下几点：
一、拉网、运输鱼种时尽量减少机械损伤。
二、控制放养密度，密度过大，鱼类自身排泄物增多，水库水源补给不足，容易造成水质败坏。
三、严格进行鱼体消毒。坚持在鱼种投放时用药物进行鱼体消毒，可用浓度为2%～3%的食盐水浸洗5～10分钟或用20毫克/千克的高锰酸钾溶液药浴15～20分钟。
四、科学投饵，不要造成浪费污染水质。
五、谨慎使用畜禽粪便肥水，确有必要，一定要经过消毒发酵。
六、使用微生物制剂（如芽孢杆菌、EM菌等）调节水质，1次/月。
七、药物杀虫、消毒预防：
1、把握时机。春季可掌握在清明后雨季来临之前，秋季可选择在白露前后，夏季干旱水位较低时。
2、选择药物。常规品种寄生虫无非是中华鳋、锚头鳋、指环虫等，杀虫首选阿维菌素，严禁使用菊酯类、有机磷杀虫剂，因为大水体的青虾等资源是一笔不小的财富。消毒药物氯制剂、溴制剂、碘制剂等都行，这里推荐用泡腾片，因为操作方便。
3、剂量控制。一般正常水位按3米水深计算用量，干旱季节按实际水深计算。如果水质较肥可适当加大用量。
