1、土壤消毒：在种植百合前要进行土壤消毒，常用的消毒方法有蒸汽消毒和化学消毒两种方法。蒸汽消毒由于耗能多，操作麻烦，目前很少使用。化学消毒是用 40％的福尔马林配成1：50或1：100倍药液泼洒土壤，用量为2.5公斤／平方米，泼洒后用塑料薄膜覆盖5－7天，揭开晾晒10－15天后即可种植，或用多菌灵原粉8－10g／m2撒入土壤中进行消毒。
2、种球的解冻和消毒：种球到货后立即打开包装放在10－15℃的环境下进行解冻，待完全解冻后进行消毒。消毒方法：将种球放入千分之一的克菌丹、百菌清、多菌灵、高锰酸钾等水溶液中浸泡30分钟，也可以将种球放入80倍的40％的福尔马林溶液中浸泡30分钟，取出后用清水冲净种球上的残留溶液，然后在阴凉的地方晾干方可定植。国内有的种植基地，在定植前，剪去原有的基生根，这样有利于促发新的基生根。
3、种球的贮存：解冻后的种球若不能马上种完，不能再冰冻，否则就有发生冻害的危险，可以存放在0－2℃条件下，但最多只能存放两周；也可以存放在2－5℃环境中，最多可存放一周，同时必须打开塑料薄膜包装。
