交易产品不同；证券交易所市场主要交易上市公司的股权，场外交易市场主要挂牌转让非上市公司股权。
交易方式不同；证券交易所市场采取指令驱动的集中竞价交易制度，而场外交易市场一般是采用报价驱动的做市商制度。
准入门槛不同；证券交易所市场上市的公司，主要面向大型、成熟或者处于高速成长期的企业，门槛非常高；场外交易市场主要面向初创期或成长初期的企业，其准入门槛相对低。
承担义务不同；证券交易所市场上市的公司，不但要履行严格的信息披露义务，还要接受监管部门、交易所、中介机构、投资者和市场各方的监督，对其规范运作提出很高的要求；而在场外交易市场挂牌的企业，其承担的义务相对来要少。
上海股交中心Q板、E板、新三板皆属于资本市场场外交易，证券交易所市场属于场内市场，由主板、中小板（通常将主板和中小板合称为“主板”）、创业板构成。上海股交中心Q板E板和新三板是比证券交易所市场较低层次的资本市场，它们与交易所市场通过转板机制建立起企业在不同层次市场之间的流动,构成我国的多层次资本市场。
Q板挂牌办理时间在1个月左右，E板和新三板挂牌在6个月，但E板和新三板挂牌成功的企业均可得到政府相应的资金补助，每个地区不同，具体补助金额可到当地市政府询问确定，一般在100万左右。
