一个疾病的病因，往往与很多因素有关，系统性红斑狼疮便是如此。该病是一种终身性的自身免疫病，病因是极为复杂的。系统性红斑狼疮应以防治为主，致病因素主要包括遗传、环境、感染、内分泌等。
系统性红斑狼疮病因举不胜举，研究发现该病与遗传有关，有家族聚集因素。同时，该病是环境因素造成的。在系统性红斑狼疮病人身上可查到多种自身抗体如抗核抗体，抗单链、双链DNa抗体，抗组蛋白抗体，抗RNP抗体，抗Sm抗体等。以上均属抗细胞核物质（抗原）的抗体。其他尚有抗细胞浆抗原抗体，如抗核糖体抗体，抗血细胞表面抗原的抗体，如抗淋巴细胞毒抗体，抗红细胞抗体，抗血小板抗体等。
除此之外，免疫因素也是占有较大比重的。狼疮病人皮肤中查到免疫复合物沉积。系统性红斑狼疮主要是一种免疫复合物病这是引起组织损伤的主要机理。多脏器的损伤也多是免疫复合物沉积于血管壁后引起。在胸水、心包积液、滑液、脑脊液和血液中均能查到免疫复合物。免疫复合物最主要是由DNA和抗DNA抗体形成。
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