1、品种选择：尽量选择株型收敛，通风透光好的品种。
2、精选种子：播种前，将种子过筛以清除混杂于种间的菌核。
3、深翻：发病严重的地块，实行秋季深翻，将土表的菌核埋入20厘米以下的土层内，子囊盘柄在土中得不到光照，不能发育形成子囊盘，可减少浸染来源。
4、轮作：应与禾本科作物实行3年以上轮作。
5、排水与施肥：尽快排除田间积水，降低田间湿度，适量少施氮肥可减轻发病。
6、铲趟：在菌核萌发期铲趟，能破坏子囊盘，较大程度地减轻发病。
7、栽培密度：在雨水调合年份，尽量降低栽培密度，既不影响产量，又不利于发病。
8、药剂防治：菌核发病初期，用百分之40纹库利可湿性粉剂800至1200倍液或百分之50速克灵可湿性粉剂2000倍液叶面喷雾，隔7天补喷1次，在该致病真菌子囊盘萌发盛期，可用百分之40菌核净可湿性粉剂1000倍液喷雾，有较好的控病效果。
防治大豆菌核病
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