水产可持续的健康养殖模式应当是品种结构搭配合理，投入和产出水平适中，水产养殖业与种植业、畜禽养殖业及水产品加工有机结合的生态渔业模式，通过养殖系统内部循环再利用，达到对各种资源最佳利用，最大限度地减少养殖过程中废弃物产生，在取得理想养殖效果和经济效益同时也取得最佳的环境生态效益。
开展健康养殖，要严格水产苗种、养殖环境、投喂饲料等管理，要大力提倡和应用生态防病、诊断技术，禁止使用国家规定的违禁渔药，推广使用绿色环保型渔药。要从改良水生动物的遗传性能入手，筛选培育并推广应用抗病能力强的品种，防控病原体侵袭。要根据不同养殖种类、不同生长阶段，开发应用配比合理、营养全面的全价配合饲料，同时应针对各种养殖动物的摄食习性和特点科学投喂，最大限度地减少饲料的浪费和对养殖环境的污染。在水产养殖生产中，要借鉴这些有益的生产方式，改善养殖生态环境，提高水域的渔业效能。
要科学规划生产布局，根据水域环境可提供的最佳效能，合理地安排水产养殖生产。对一些老旧的养殖区域可采取休渔、变换养殖的方式，改变养殖品种等方式，调节、改良水域生态环境。
