苗期常见病害有炭疽病、疮痂病、细菌性角斑病和一些真菌性的叶斑病，常见害虫有横线尾夜蛾、毒蛾、尺蠖、蚜虫等，出圃前摘除病叶虫梢，并喷施百菌清加乐果。若发现新的危险性病虫害（如芒果果核象甲、橘小实蝇等），则应加强检疫，及时处理，防止其扩散蔓延。
开阔地或向风地新植区应同时考虑营造防风林网带减少风害。1-2龄树主要任务是培养树冠，必须加强肥水管理施足基肥，做到“每梢一肥”，促使抽梢期整齐，多雨季节注意树冠周围除草。定植后新梢3-5厘米时应开始防病杀虫，可用乐果、敌敌畏、敌百虫加杀菌剂多菌灵、甲基托布津等进行叶面喷雾，每梢施药防病杀虫2次，须注意药剂的轮换使用。新梢叶片转绿前，应特别注意防治细菌性角斑病和炭疽病。提高树冠叶片的质量和数量，大大促进幼龄树早生快发，增强树势，合理修剪，培养骨干枝，为进入投产期打下良好基础。
芒果幼龄树综合防治技术
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