汉为温宿国地，唐置温肃州，州治大石城。又称作于祝。元、明以来有倭赤、乌赤等名称，或为其地。清乾隆二十年（1755年）后地名汉文定为乌什。乾隆二十四年（1759年）设乌什办事大臣，光绪九年（1883年）设乌什直隶厅，隶阿克苏道。
民国2年（1913年）改直隶厅为乌什县。
1929年后行政区划均属阿克苏地区。
2000年，乌什县辖1个镇、8个乡：乌什镇、阿克托喀依乡、阿合亚乡、阿恰塔格乡、亚科瑞克乡、依麻木乡、英阿瓦提乡、奥特贝希乡、亚曼苏柯尔克孜族乡。 根据第五次人口普查数据：全县总人口177410人，其中：乌什镇 22112人、阿克托海依乡 20626人、亚科瑞克乡 15276人、阿恰塔格乡 16626人、阿合亚乡 31876人、依麻木乡 20225人、英阿瓦提乡 14760人、亚曼苏柯尔克孜族乡 8267人、奥特贝希乡 20534人、兵团四团虚拟乡 7108人。
