只有在生产环节实现水产品质量安全，才有可能实现水产品全程安全，因此在生产过程中一定把握好以下几个影响水产品质量安全的因素：
（一）苗种安全：选购苗种一定选择有苗种生产许可证、信誉好、质量高、合法经营的企业和个人来购买。
（二）养殖水质安全：在养殖水质存在着水质恶化和底质恶化的现象，主要原因是放养密度大、代谢产物积累、饲料残渣沉淀长期作用造成的，在养殖过程中、要定期不定期的对水质进行检测化验，使水质达到国家渔业水质标准。对养殖水体水质超过国家标准时，要采用物理方法、化学方法和生物方法改善水质状况、是水质达到养殖用水水质标准。
（三）加强鱼药使用安全：鱼药的使用不能危害鱼类的健康、不能破坏养殖水体环境、不能对人体健康产生影响，因此在养殖过程中应防止滥用鱼药，盲目增大用药量和增加用药次数、延长用药时间的现象、严禁将人用药作为渔药的主要或次要成分，商品鱼上市前应有足够的休药期、严禁使用《农业部》发布的氯霉素、孔雀石绿等29种禁用鱼药；鱼病的防治要坚持“防重于治”的原则，做好预防，尽量减少药物的使用。
鱼用饲料安全：饲料的选择要能保证原料的质量，达到配方合理，能适应不同品种、不同养殖阶段、不同的环境条件的要求，符合养殖对象最佳生产营养要求和安全。在投喂过程中，应坚持“四定”原则，防止因投喂过量饲料造成沉淀和浪费，影响底质和水质，产生致病源，影响水产品质量。
