食用菌的标准化生产技术体系能保证食用菌产品的优质安全。2003年2月，中国食用菌协会根据国内外食用菌生产的现状，提出了实施食用菌标准化生产的意见。标准化生产包括：
（1）食用菌产品生产环境的标准化：菇房、菇棚的建造选址都要求地面平坦、开阔、高燥、通风良好、排灌方便。周围环境卫生，无有害气体、废水、垃圾和污染源，如农药厂、化工厂、印染厂、电镀厂、皮革厂等，并远离禽畜场、垃圾站和堆肥场等不洁场所，生产用水源符合饮用水卫生标准。使用发酵料栽培的，菇房附近要有足够的场地用来发酵，且发酵场与菇房至少间隔100米，中间有建筑物或绿化带作间隔，以阻止发酵场的病虫害侵染菇房。
（2）投入品的标准化：生产过程中尽可能少地使用化学添加剂，应尽量使用物理方法制造的添加剂，如石灰、石膏，不使用成分不清的三无产品。
（3）生产过程的标准化：选育和引进优良菌种，提供良好的生态条件，认真防治病虫害，以预防为主，从而减少和避免农药的使用。当病虫害发生严重，必须化学防治时，一定要将菇（耳）全部采收后再用药，任何情况下都不能将农药直接喷洒在子实体上，并使用高效低毒药物，待残留期过后再催蕾出菇。
（4）食用菌产品及其加工品的标准化：加工过程中使用各种漂白、保鲜等添加剂不能过量，要严格按照使用说明来做，不能为盲目追求产品颜色而过量使用。
（5）食用菌产品及其加工品包装、贮藏、运输、营销的标准化：不同种类食用菌要采取相应的包装、运输策略，鲜品可以采取速冻、低温、调气等方法进行保鲜，干品则要尽可能保证干制过程中其营养物质不被破坏，密封包装和运输。
如何保证食用菌的优质安全？
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