[拼音]：banzhijun yamen
[外文]：Deuteromycotina
真菌门的 1亚门。因在其成员的生活史中仅发现了无性阶段而得名。它们为具简单隔膜（少数种具桶孔隔膜）的分枝菌丝体，菌丝每个细胞中常含多核。分生孢子梗单生、簇生或集结成孢梗束，其内（外）合生或离生产孢细胞，产孢细胞产生形形色色的分生孢子。
本亚门真菌只能以分生孢子或菌丝的断片进行繁殖。由于半知菌的异核体现象为其隐性基因提供了庇护场所，异孢质作用增加了其遗传变异的广度和深度，准性生殖又为其核基因的交换提供了手段，从而使其能在物种形成与进化的长河中，得以保存并繁衍下来，发展为今天这样一个种类多、繁殖快、分布广、适应性强的重要类群。
半知菌多腐生于陆地或水中。
1935年，W.B.格罗夫和1983年，D.L.霍克斯沃思将本亚门下分丝孢纲和腔孢纲2纲，约17000种。有些种是人类和动、植物的致病菌；有些种能导致食品腐败以及原料、器材的腐蚀或变质；有些种的代谢产物可用于制取抗生素（如产生青霉素的青霉、产生头孢霉素的头孢霉等）、有机酸和酶制剂；有些种可用于有害昆虫和杂草的生物防除。同时，半知菌也在生态系统中的物质和能量转化中起重要的作用。
以往发现的半知菌中，有些种因为又相继发现了它们的有性阶段，而分别归属于子囊菌亚门（多数）和担子菌亚门（少数）中，所以有的学者提出“半知菌是子囊菌的分生孢子阶段，或者少数种是担子菌的分生孢子阶段，它们的有性阶段未曾发现或已丧失”的见解。