(一)有利于填补监管真空、维护股东权益
股份制是现代企业的一种资本组织形式。它有利于所有权与经营权的分离，有利于提高企业运行和资本运营的效率，有利于实现企业规模化扩张，对推动政企分开，促进企业转换经营体制，优化资源配置，实现经济结构调整具有重要作用。股权自由流动是股份制企业区别于其他企业的显著特征。非上市股份有限公司的股权流动是股东通过协议以背书方式进行的。由于缺乏专门的非上市股权交易所，非上市股权一般都在私下进行转让，政府部门难以监督，交易纠纷时有发生。特别是在国有股份转让过程中，极易出现“暗箱操作”，导致国有资产大量流失，严重损害了国有股东和其他投资者的合法权益。股权集中登记托管以后政府部门通过托管机构就可以监管所有非上市股份有限公司的股权交易行为，规范股权管理，维护股东权益，促进股份制经济健康发展。
(二)有利于建立股权交易市场，推动经济结构调整
股权托管以后，由于股权登记管理集中、股权转让信息集中，规范的交易行为、低廉的交易成本、公允的交易价格、广阔的选择空间，必然驱使各方投资资金包括外资自动汇集，形成市场。这种集中统一的市场，不仅为政府规范管理，杜绝私下交易创造了条件，而且有利于充分发挥市场机制优化配置社会资源的作用，为国有经济有进有出提供了一条通道。可以断言，股权交易市场的建立，外资与社会闲散资金的引入，必将有利地推动经济结构调整和优化步伐。
(三)有利于发展多层次资本市场，为建立三板市场创造条件
商品市场、资本市场、劳动力市场是市场经济体系的三大支柱。市场经济主体大小不一的多层次性，客观上要求要有多层次的资本市场与之进行配套服务。但是目前我国的资本市场尚做不到这一点。除上市公司可以通过发行股票融资以外，大部分非上市企业的融资几乎全靠银行贷款，而银行贷款要求企业必须提供可靠的资产作抵押，从而增加了企业融资的难度。当前非上市企业资金严重缺乏与社会大量资金闲置的矛盾已经非常突出。开放地方性“三板市场”为大量中小企业提供一条直接融资渠道的呼声已越来越高。对非上市股份有限公司股权实行集中登记托管和建立股权交易市场这项工作的开展，将为建立区域性资本市场，利用当地经济资源持久地促进当地经济发展积累经验，打好基础，创造条件。
