医疗保险机构的基本任务是按照国家的有关法规，在一定的区域和人群中合理有效地开展医疗保险业务，为促进居民健康提供经费保证。其具体任务包括：
1．参与制定政府医疗保险的法规、政策和计划
由于医疗保险活动是一种专业性很强的活动，在政府制定有关政策法规和计划时，需要有医疗保险机构的参与。医疗保险机构根据自身掌握的第一手资料，主动为政府制定医疗保险政策法规和计划提供合理依据和建议，也是保证有效开展医疗保险业务的前提。
2．筹集医疗保险资金
其工作包括对医疗保险市场的调查研究；医疗保险主要指标的预测和测算；对所在地区居民和单位进行参加医疗保险知识的宣传教育；选择有效方式组织交纳保险费等。
3．保证医疗服务的提供
医疗保险机构一般并不直接为参保人提供医疗服务。然而，为了提高医疗保险的效率和效益，保险机构有必要负责选择和组织适当的医疗机构提供合理适宜的医疗服务，包括：选择适当的医疗服务提供机构和提供者(医疗保险定点医疗机构)；选择和确定适宜的医疗服务范围、技术和服务方式；组织一些直接医疗保健服务，如疾病预防、被保险人的健康检查、健康教育和健康促进等活动。
4．支付被保险人的医疗服务费用
这是医疗保险机构最基本的日常工作。主要包括选择合适的保险支付方式、检查和审核医疗服务的提供情况和大量日常财务会计工作。
5．对医疗服务提供方和被保险方的监督和控制
对违反医疗保险法规和制度行为的监控是开展正常医疗保险业务不可缺少的重要工作。与其他保险业务不同的是，医疗保险机构必须同时监控医疗服务提供方和被保险方的行为。其工作范围包括：按有关规定对医疗服务范围、种类的监控；对服务价格和收费和监控；对所提供医疗眼务的水平和质量的监控；对被保险人违反保险条例的欺诈行为的监控等。
6．医疗保险基金的管理
尽管医疗保险基金相对于其他保险基金而言，有周转较快，沉积时间较短的特殊性，但仍有相当的资金沉积。为了保证沉积的保险基金的保值和增值，提高抗风险能力，保险基金的管理是医疗保险机构的一项重要工作。其主要工作包括对基金的核算、分配、分析和沉积基金的开发利用。
上述六个方面构成了医疗保险机构的基本任务，可简单概括为：计划、筹资、服务、付费、监控和管理。
