西林子乡名源于驻地西林子屯名。始建屯落时，因其位于小安（南）河下游北岸，由河口西望为一片丛密参天的杨桦树林，故称“西林子”。本世纪20年代，一些山东“流民”来此以西辟林垦田，种植罂粟，并有朝鲜族来此开垦水田，属饶河县长泰区辖境。东北沦陷后，初隶第二区，1938年日伪统治者实行“归屯并户”，设西林子村。
1945年“九三”抗日战争胜利后，隶属第二区。
1954年7月，撤区设村，设置小南河村。
1956年6月，设置西林子乡。
1958年10月，改称西林子人民公社。
1959年1月，“场社合并”，隶属八五九农场二分场。
1962年3月，“场社分开”，恢复西林子公社。
1984年4月，改为西林子乡。
1985年8月，将沿江四排村和马架子林场划归新设置的四排赫哲族乡。
