三汊埠历史悠久，早在东周时期，就有先民人在境域活动，有搭墙院遗址。
南北朝时期，三汊埠就是孝昌县境内的一个水埠码头。《孝感县志》载：“刘宋孝武帝孝建元年（454年），孝昌县令外出巡视，曾驾舟沿野猪湖北岸支河登三汊埠古街码头视事”。
唐贞观年间（627年—649年），三汊埠已成为通江达海的重要水运码头。
清代，三汊地域属孝感县诸赵乡所属。
清朝末年至抗日战争前夕为鼎盛期，曾是“日有百桅林立，夜有千点灯火”，被誉为“小汉口”。
民国时期，先后属孝感县第二区、孝感县新民乡、中正乡所辖。
新中国成立初期，属孝感县三汊区。
1952年—1974年，三汊和祝站分和多次，1975年2月撤区并社，将原祝站区所属的三汊（现埠镇）、赵陈、草店、诸赵和原龙店区所属的涂店5个小公社合并成立三汊人民公社，计22个生产大队和1个农科站，国土面积84.6平方千米。
1985年7月，经湖北省人民政府批准，设立孝感市（县）三汊镇，计有43个行政村和2个居委会。
1993年撤销孝感市（县），设孝南区和孝昌县，本镇属孝南区所辖。
2007年8月，本镇划出9个行政村归孝感市高新技术开发区孝天办事处托管。2015年，三汊镇辖31个行政村，3个社区。
