明末清初，回族、汉族陆续迁入，藏、回、汉各族杂居，牧耕兼作。清乾隆五年(1741年)闰三月，西宁道佥事杨应琚以地处适中扼要，水草丰广、地土宽平，议准筑成土城一座。乾隆六年至八年(1741年--1743 年)，招募藏、汉、回族在巴燕戎等地垦荒种地。乾隆九年(1744年)，设巴燕戎格抚番厅。
民国2年(1913年)改厅为县后，巴燕镇为县治所在地。
民国19年(1930年)，巴燕属第一区。24年(1935年)，设立巴燕镇。
1949年9月4日，巴燕镇解放，继而建立了新政权，成为中共化隆县委和县人民政府机关所在地。
1950年元月1日，改巴燕镇为巴燕市，隶属第一区。
1952年8月1日，改为巴燕乡，隶属第一区。
1956年撤区并乡为巴燕乡。
1956年9月26日，改为巴燕镇。
1958年9月1日，改为巴燕公社，1966年复设巴燕镇，1958年与阿什奴乡合并成立巴燕公社。
1984年8月14日改为巴燕镇。
2001年，撤销加合乡，并入巴燕镇，镇政府驻巴燕，辖1个居委会（巴燕）、38个行政村。
原【加合乡】化隆回族自治县辖乡。位于县境中部，距县政府3千米。地处黄河谷地北侧山地、沟谷地。
民国时设若力尕乡，1950设加合乡，1958年与黑城、二塘乡合并成立城西公社，1962年分设加合公社，1984年改加合乡。
1996年，面积125.3平方千米，人口1.7万人，其中回族占60%；辖上地滩、下地潍、庙尔沟、马场、寺尔沟、上拉干、中拉干、辛家瑶、窑湾、李家庄、阿扎卜扎、后沟、藏滩、上加合、下加合、上吾具、下吾具、卜隆、上卧力尕、下卧力尕、下沟、下山根、水乃海、克麻24个村委会。
