《穆天子传》中有西周穆王西见西王母曾途经此地“北登孟门”的记录。这里还有龙山文化遗址。春秋战国时期为赵国边邑蔺。汉元朔三年(前126)，汉武帝封其代共王子熹为蔺侯；元朔四年(前125)，置西河郡。北周大象元年（579）置定胡县，兼置定胡郡。唐武德三年(620)， 置西定州 ；贞观二年(628)， 废西定州，改定胡县为孟门县；七年(633) 废孟门县，置孟门镇；八年(634) 废孟门镇，复置定胡县。是地跨今柳林、离石、临县(临县三交以南大部分，包括今天著名的碛口在内) 以及陕西省吴堡县全境的政治、经济、文化中心。直到金至元年间(1264一1294) ，废孟门县。原辖河东部分的青门、文北二都划归石州；招贤、豫居二都划归临县；源远、福禄二都划归宁乡（今中阳。此二都大部分境域在1971年设柳林县时划归柳林）；河西部分划归陕西吴堡。又在孟门设巡检司。此前，为县治、州郡治驻地达700余年。清雍正元年（1723），黄河大水，孟门遭淹。道光二十二年(1842) ，六月十六日，天降暴雨，黄河泛滥
成灾，孟门古城“舟行于街，涛响于市”。南山寺八景毁坏大部。咸丰六年(1856)，因连下数日暴雨，孟门镇连云广厦倏尔陷入狂涛巨浪之中，200余孔窑洞、l 000多间房屋被水冲光。《柳林县志》载，孟门古有河滩水地千余亩，遍植桑枣。纺织品行销黄河两岸，西通“丝绸之路”，而今桑田也已毁于洪灾。此后，集市贸易移向距离原孟门古城南1公里的枣峁上村。群众依靠手工挖煤运炭、植桑养蚕、出售红枣重建家园，而以出卖劳力为生的纤夫、艄公、赶牲灵的人也很多。因而孟门至今仍保留了一部分明清民居，有关专家称：多次黄河水毁后的孟门能在短时间内再次崛起，这几乎是个奇迹！1958年，组建孟门人民公社管理委员会于枣峁上，遂易村名为孟门。
1964年8月12日晚，黄河沿岸突降倾盆大雨，黄河漫溢，孟门、军渡二公社水毁严重。
1977年孟门、军渡黄河防护坝被冲垮。
1984年5月12日，经省政府批准，孟门废社设镇。2002年，吉家塔乡与孟门镇合并，称孟门镇。
