后晋天福四年（939），升大同场为同安县，正式升场置县，辖3乡11里，隶属于泉州府。辖区包括今厦 门、同安县、金门县及龙海一部分。唐光启二年(886年)，王潮克泉州为刺史，至947年，南唐并吞闽国，同安地为王潮和闽国治地，历时61年。王潮、王审知兄弟先后为威武军节度使，同安为其治地，闽国开平元年909年，王审知为闽王，立闽国，都福州，大同场为其辖地。949年，南唐升泉州府为清源军（辖今泉州、厦 门、莆田、漳州）。963年，宋改清源军为平海军，以陈洪进为节度使，同安县升平海军。北宋太平兴国三年(978年)，陈洪进纳土于宋，同安县始随平海军纳入宋土。同年，宋复平海军。
宋同安县下辖3乡33里，后并为27里，再缩为11里，即同禾、民安、翔风、嘉禾（以上属绥德乡）、长兴、从顺、感化、归德（以上属永丰乡）、仁德、安仁、积善（以上属明盛乡）。
元代改里为都，3乡之下统44都。永丰乡下辖原从顺里西界1～5都，原感化里西界6～8都，原归德里西界9～10都，原长兴里东界1～3都，计13都；明盛乡下辖原仁德里西界11～13都，原安仁里西界14～16都，原积善里西界17～20都，计10都；绥德乡下辖原同禾里东界4～7都，原民安里东界8～11都，原翔风里东界12～20都、原嘉禾里西界21～24都，计21都。元代属于泉州路。
明洪武元年（1368年）恢复里制，里下辖都。增置在坊里辖县城2隅。全县共划3乡12里2隅44都。洪武二十年为防倭患，尽徙大小嶝岛2都人民于内陆。永乐元年（1403年）从顺里5都并为3都，感化里3都并为1都，长兴里3都并为1都，归德里2都并为1都，县辖3乡12里2隅35都。后都下设图。成化六年（1470年），大、小嶝2都人民奏复其旧。至此，同安县下辖12里2隅37都53图。洪武二十七年（1394年）始筑“厦门城“。清顺治七年（1650年）郑成功驻兵厦 门，十二年（1655年）在同安县 绥德乡 嘉禾里 改置思明州；康熙十九年（1680年）废。
清代开始，隶属福建兴泉永道。康熙二十三年（1684年）从兴泉道管辖下设台厦兵备道，康熙二十五年（1686年）以泉州府同知分防设厅，雍正五年（1727年）起属于兴泉永道，兴泉永道辖今泉州、莆田、厦 门，永春州、大田县，道台自泉州移驻厦 门。清沿明制。乾隆四十年（1775年），析翔风、民安2里（丙洲除外，划归从顺里）及同禾里的五、六、七都置马巷厅。光绪间行保甲制，改图为保。至
，同安的行政建制层级为：县→乡→里→都→保→甲（每保10甲，每甲10户）。全县共3乡9里21都。
民国元年(1912年)，撤府，兴泉永道改名南路道，民国3年改名厦门道，管辖厦 门、莆田、泉州和大田县，4月，划出同安县绥德乡嘉禾里置思明县，9月升思明府，不久废。
民国元年（1912年），裁马巷厅复归同安县。至民国36年，稳定为13乡镇150保2325甲，保持至1949年9月同安解放。
民国四年，1915年划出 金门岛和附近岛屿设置金门县。
1933年 “中华共和国人民革命政府”（即“福建人民政府”）设厦门市，厦门市成立，旋改特别市，同安县和厦门市隶属兴泉省（治所泉州），兴泉省辖今泉州、莆田、厦 门， 翌年1月“闽变”失败后，厦门特别市政府和兴泉省撤销，厦门岛内恢复思明县建制，与同安县均属福建省政府直辖。
1934年同安、思明县属第五行政督察区（驻地同安县）。
1935年4月以厦门及鼓浪屿等7个岛屿设厦门市，撤销思明县设禾山特种区，与同安县同属第四行政督察区（驻同安，辖今厦 门、泉州、莆田）。
1938年5月至1945年9月 厦门岛沦陷， 同安县仍隶属福建省第四行政督察区。
1949年9月 中国人民解放军第十兵团进入了福建大陆，攻入厦门， 后金门战役（古宁头战役），金门炮战。详见金门战役、金门炮战相关 文章和词条（1979年中华人民共和国国防部部长徐向前发表了《停止炮击大、小金门等岛屿的声明》，历时21年的金门炮击，正式划上了句号）。
1949年9月 隶属于福建省第五行政督察专员公署，驻地泉 州，管辖泉州、莆田、厦门。
1950年7月 改属福建省泉州地区行政督察专员公署，管辖泉州、莆田、同安县，后改名为晋江专区。
1953年11月 划出同安县集美乡到厦门市郊。
1958年10月 从晋江专区划出改隶于厦 门。
1970年8月 再划归晋江地区。
1973年9月 归隶厦门市。
1949年后县以下建制历经区、乡、公社、乡镇、镇的变更。
1996年12月 全县辖19镇、场（不含良种场），共18个居委会213个村委会。辖域面积由解放初的1481平方公里缩小为1078.55平方公里。
1997年05月01日，撤销同安县，设立同安区。
2001年06月08日，调整行政区：一、撤销大同镇，设立大同街道，将洪塘镇所辖康浔村、下溪头村、东宅村3个行政村划归大同街道。二、设立祥平街道。1、将大同镇所辖陆丰社区、西溪社区2个居委会和过溪村、祥桥村2个行政村划归祥平街道；2、将新民镇所辖杜桥村、西洪塘村、西湖村、凤岗村、溪声村5个行政村划归祥平街道；3、将西柯镇所辖瑶头村、卿朴村、阳翟村三个行政村划归祥平街道。祥平街道辖陆丰、西溪、祥平3个居委会和过溪、溪声、凤岗、祥桥、杜桥、西洪塘、西湖、阳翟、卿朴、瑶头10个村。
2003年04月26日，国务院批准：设立厦门市翔安区，将厦门市同安区所辖新店镇、新圩镇、马巷镇、内厝镇、大嶝镇5个镇划归翔安区管辖。行政区划调整前：同安区面积1048平方千米，人口55万。行政区划调整后，同安区下辖大同街道、祥平街道等2个街道办事处，新民镇、五显镇、洪塘镇、汀溪镇、莲花镇、西柯镇等6个镇以及竹坝开发区、凤南农场、白沙仑农场和81个行政村、42个社区居委会。区人民政府驻祥平街道。
