一、 浅灌、晒田
水稻是一种沼泽植物，但其根不是水生根。为满足稻根对氧气的要求，在水稻生长期间须调节灌水深度及时间。在植株分蘖期宜浅灌，以利水稻生根分蘖; 当分蘖达一定数量时，应排干田水和晒田，控制其继续分蘖; 至伸长期和孕穗期均需较大水量。浅灌期鱼种尚小，晒田时（约7~10天）鱼类可在沟溜内栖息; 随着鱼体长大，田水也在逐步加深。因此，只要不是饲养较大的鱼，稻鱼矛盾不是很大。
二、 施肥
稻田追肥主要使用铵态氮肥及酰铵态氮肥，施肥前通常要降低水位，而且施肥量较大，施肥后田水肥料浓度高，特别是铵态氮升高，对鱼的安全有威胁。为解决这一矛盾，可采用分段间隔施肥的方法，一块田分两次施，每次在一半田块施肥，两次间隔1~2天，使鱼在施肥时可以向另一半田块回避，也可先排去田水，使鱼集中在沟凼中，然后施肥，施肥后1~2天注水入田，对鱼即无影响。
三、 施农药
稻田养鱼后害虫大为减少，但不能完全消灭，有时仍需使用农药杀虫。多数农药对鱼有毒。解决的办法一是选用低毒性农药，例如井冈霉素、敌百虫、敌敌畏、甲胺磷、乐果、杀虫脒、稻瘟净、4049等，按常规用量对鱼是安全的。二是在施农药前先疏通沟溜，加深田水水位或造成田水微流状态，以便于鱼类回避和降低田水药物浓度。三是选择正确施药方法。粉剂在早上有露水时喷撒，水剂在露水干后喷洒，使农药尽量少落入水中。
