鱼类常生活在水中，发生病害后通常多用全池泼洒法，经常会出现用药不准、用量较大或用药不足的问题。而内服药多为中草药，用药方法应注意以下几个方面：
一、计算准确的用药量。通常情况下，除鲢、鳙滤食性鱼类，内服药对它们不起作用。像鲤、鲫、草、鳊等吃食性鱼类，主要摄食人工饲料，可以通过将内服药拌入人工饲料中来防治疾病。通常可根据存塘鱼体重5%～8%来确定吃食量，再根据吃食量的多少计算用药量，不同种类的内服药用药量不尽相同，视具体情况而定，决不能主观臆断。
二、掌握正确的用药方法。一是选择养殖鱼类爱吃的饲料投喂，最好为颗粒料，总投喂量约比平时少 20%左右，并用合适的粘合剂加拌均匀，待通风处阴干后再投喂，以增加药饵粘合性，防止造成饵料浪费。二是在投喂时应均匀，让全池鱼类都能吃到药饵，投喂面积要大，动作要慢，使用投饵机应将间隔时间拉长。尽可能避免药饵摄食不均匀，影响鱼病防治效果。三是内服药饵必须按要求连续投喂一个疗程，一般为 5～7天。待内服药发生作用，且病鱼停止死亡之后，还要再继续投喂 1～2 天，若过早停药，鱼体内的病原菌未被全部消灭，容易复发。在制作药饵时应多加些鱼粉和炒熟的黄豆面、小麦粉等，散发香味来诱鱼摄食。此外，还应将药饵做成适当的大小，保证适口性。
三、注意必要的配伍禁忌。不同的药物具有不同的功效。在没有充分掌握药性的情况下，一般不提倡内服药相互混用。混用不当，轻者会减低效果，重者还会造成伤害。如五倍子会降低许多化学药物的功效，黄芩与氢氧化铝可形成络合物，大黄遇含重金属离子的药物及生物碱等会使生物体内维生素 B1散失，若将它们混用就会达不到预期效果。此外，苦楝皮不能与绿豆、甘草等混用，黄连不宜与碘制剂、碱性药物、重金属盐、维生素 B6等同时混用，诺氟沙星禁与氟苯尼考混用。
