[拼音]：yaoyong zhenjun
[外文]：medicinal fungi
作为药物用以治疗疾病的真菌。它们在生长、发育的代谢活动中，能于菌丝体、菌核或子实体内产生酶、蛋白质、脂肪酸、氨基酸、肽类、多糖(见碳水化合物)、生物碱、甾醇、萜类、苷类以及维生素等具有药理活性或对人体疾病有抑制或治疗作用的物质，临床上或是直接利用菌丝体、菌核或子实体，或是利用从菌体中分离出来的有效物质。
真菌类药物广泛，通常所说的药用真菌多限于在生长发育的一定阶段能够形成个体较大的子实体或菌核结构的高等真菌，其中大部分属于担子菌亚门，少数属于子囊菌亚门，在酵母等其他真菌中也有少数种具药用价值。能产生抗生素的真菌作为药物历史悠久。早在2500年前，中国就已采用酒曲治疗肠胃病。中国东汉初期的《神农本草经》及以后历代本草书内就记载有灵芝，常用的种类有赤芝、紫芝、茯苓、猪苓、雷丸、大秃马勃、紫色秃马勃、冬虫夏草、僵蚕、香菇、木耳以及蝉花等，这些药用真菌都经历了长期的医疗实践，疗效得到了充分的验证，至今仍被广泛地应用。
临床上常用的药用真菌还有银耳、麦角、落叶松蕈、空柄假牛肝菌、大红菇、白乳菇、竹黄和糖谷老等百余种。
药用真菌按其功效可分成滋补强壮类：如冬虫夏草、银耳、灵芝等；利尿渗湿类：如猪苓、粟白发等；止血活血消炎祛痛类：如麦角、肉球菌、木耳、安络小皮伞、马勃、朱红栓菌；止咳化痰类：如金耳、竹黄；安神类：如茯苓；驱虫类：如雷丸；祛风湿类：如空柄假牛肝菌、大红菇；平肝息风类:如蝉花、变绿红菇；降血压类:如草菇；调节机体代谢类：如蜜环菌、香菇、鸡油菌等。
药用真菌的来源有野生采集、人工栽培和发酵培养3个途径。野生资源不仅稀少，也不易采集，且受生态环境及季节等自然条件的限制。有些种类如冬虫夏草、麦角等的野生产量已满足不了临床的需要。人工栽培的蕈菇类多采用段木栽培或锯木屑瓶栽。目前以茯苓、银耳及黑木耳的生产量较大。近年灵芝的段木栽培也获成功。锯木屑瓶栽的主要原料为锯木屑、麦麸或糠皮，也可加入少量糖类、石膏或硫酸铵等。灵芝、银耳、茯苓和猴头等都可采用木屑瓶栽。人工栽培能批量生产，较野生采集有优越性。
为进一步扩大药源，改进真菌类药物的生产方法，1957年以来，中国医学科学院药物研究所等单位，在麦角栽培培养的基础上，曾先后研究成功固体培养及深层发酵培养麦角菌，提制麦角新碱的生产工艺。1970年，中国各药用真菌研究和生产单位分别对灵芝、蜜环菌、亮菌、安络小皮伞、银耳、猴头、猪苓、茯苓和云芝等进行了发酵、药物化学、药理及临床等的综合研究，制订了生产工艺，并已投产。麦角新碱、蜜环菌片及亮菌片已列为国家的科学研究成果。
此外，从银耳、茯苓、猪苓、云芝和香菇等担子菌中提制的真菌多糖，也引起国内外的重视，日本和美国都进行过大量的工作。经化学分析证明这些多糖虽结构各异，但都具有β-1，3键连接主链，和β-1，6键连接支链构成的葡聚糖基本结构。多糖化合物毒性很小，对小鼠肉瘤S-180有较强的抑制作用;它们的抗肿瘤作用机制不同于毒性类药物的直接杀伤细胞作用，而是通过提高机体免疫功能，间接抑制肿瘤的生长，从而为抗癌药物的研究与应用开辟了新途径。
为了满足临床和适应生产的需要，在药用真菌的研究工作中，需不断选育优良菌种，相应地改进栽培技术措施或发酵生产工艺，对有效成分还不清楚的一些药用真菌（如台菇及糠谷老等），应加强化学成分的分离提取等研究工作。