2005年，经江苏省政府（苏政复[2005]29号文件）和扬州市政府（扬府复[2005]10号文件）批准，江都区进行乡镇行政区划调整：将双沟镇与江都镇合并设 立仙女镇，镇政府驻江都区城区。行政区划 调整后，仙女镇行政区域面积140.38平方千米，人口23.6万，辖19个居委会、43个村委会。汉朝时名蔡家庄，元朝时称黄塘，明末清初始称仙女镇。《后汉书、郡国志》等史籍载有杜康二女在此得道升仙的传说，“仙女庙”因此而得名。
1949年解放，称仙女镇，1966年5月更名为江都镇，1978年7月改为县属镇。
1994年7月，江都县撤县设市，江都镇为区直属镇。
1995年3月，正谊乡境内4个村划入；2000年4月，原砖桥镇并入归江都镇；2001年9月，原张纲镇并入江都镇。2005年5月，经省政府批准，将双沟镇 与江都镇合并设立仙女镇，镇政府驻江都 区城区。行政区划调整后，仙女镇行政区域面积140.38平方千米，人口23.6万，辖19个居委会，43个村委会。5月21日正式挂牌成立。
