唐武德四年属桂州始安郡。光化三年（900年）始，属静江节度。五代十国时先后属楚和南汉的桂州。宋时，前属广南西路桂州，后属静江府。元时属广西行中书省静江路。明清时均属广西省桂林府。
民国二年（1913年）雁山区划入桂林县，民国29年（1940年）为桂林市太沙、柘木、东附廓、西南附廓、三合、北附廓6乡，1950年设东郊、西郊、北郊3区，1954年3区合并为近郊区，1955年更名郊区，1984年重设郊区。
1996年底行政区划调整前，原桂林市郊区位于城区四周。
1996年12月2日，经国务院批准：将桂林市郊区更名为雁山区，并对桂林市市辖区的行政区划作相应调整。将原郊区大河乡、穿山乡的清风村划归叠彩区管辖。将原郊区甲山乡划归秀峰区管辖。将原郊区的二塘乡、柘木镇的同心、平山两个村和穿山乡的安新村划归象山区管辖。
2000年，雁山区辖2个镇、1个乡、1个民族乡。
2003年，雁山区辖1个街道、2个镇、1个乡、1个民族乡。
