唐至德二年（757年），宝安县更名东莞县。香山岛地处边隅，经济落后，人烟稀少，因此东莞县在香山只设置乡级的行政编制，取名文顺乡，乡的驻地设在濠潭（今珠海市山场村）。但在另一方面，香山却是边防重地，因此朝廷特意在在香山的濠潭设置了香山镇，那是戍边的军事机构，镇将的品级与县令相等。
唐、宋以前，香山岛与珠江口北岸的广州之间，横亘着石岐海（今已淤狭成岐江）。海边有一条名叫石岐的小渔村，石岐往北大约一公里处，有一个七山环抱的小村庄，名叫仁厚村，与渔村石岐一起，统归“仁厚里”管辖。
到了北宋，香山岛上的农渔业逐渐发展，并出现了一批晒盐、采银、养蚕缫丝的场坊，于是，香山自行立县的呼声日高。宋元丰五年（公元1082年），广东运判徐九思与进士梁杞（邑人）联名上本请求建县，但只允设置香山寨，仍隶属东莞，寨址设在山场村。
南宋绍兴二十二年（公元1152年），东莞县令姚孝资采用进士陈天觉（邑人）的建议，再次向朝廷请求建县并终获诏准。以原东莞县香山镇（五桂山周围）为基础建立香山县，并划南海、番禺、东莞、新会4县的部分海岛归香山，称为香山县，隶属广州。
同年，以寨官暂代县令职务的陈天觉决定在香山岛北端石岐山（今称烟墩山）往东，直到七星峰（今石岐孙文中路西段、民生北路、拱辰路一带）之间的土地上兴建县城。据说，建城时，陈天觉曾下令“布铁沙于地以地”，所以民间把这座新县城称为“铁城”，县署则修建于仁山脚下（今石岐孙中山纪念堂公园内）。从那时候起，石岐基本上都是香山县（1925年后改为中山县、中山市）的行政机构所在地。
立县初，香山县共设置10个乡，县治所在地称为“仁厚乡”（包括今天的石岐直到南区、深湾一带）。
元初，香山县改属广州路。
明初，香山县仍属广州府。明洪武十四年，香山县改划为11个坊、都。原来的仁厚乡分划为仁厚坊和良字都，仁厚坊相当于现今的石岐，良字都相当于现今的南区。
清道光七年（1827年），香山全县11个都合并为9个都，仁厚坊与良字都合并，改为仁良都。光绪初年（约于1880年）改都为镇，全县设置9个都、镇，仁良都仍沿旧称。宣统二年（1910年）改镇为区，香山全县设置9个区，仁良都改为第一区（包括今石岐、港口、环城、石鼓一带）。
民国元年（1912年），广东省撤销广州府，香山县直属广东省长公署管辖。石岐仍为香山县县城。
民国14年（1925年）4月15日，按国民党中央执行委员会决议，经广州中华民国陆海军大元帅府批准，香山县改名为中山县，以纪念孙中山。
民国15年（1926年）8月，中山县公署改称中山县政府。
民国18年（1928年）2月，国民政府第19次国务会议确定中山县为全国模范县，实行模范县制（特别县）。
民国19年（1930年）5月，在县长黄居素和县训政实施委员会主席唐绍仪的主持下，县政府从第一区石岐移驻第六区唐家。同年7月，全县调整行政区域，区的名称改按地方命名，石岐定名为石岐镇。
民国20年（1931年）9月，全县9个区恢复按数字编列的名称，仁良区改为第一区（驻石岐镇）。
民国23年（1934年）10月，县政府由唐家迁返石岐，驻郑氏三公祠（今莲塘路）。
1940年3月7日石岐沦陷。沦陷期间，中山县三大势力鼎立：日军在石岐凑合汪伪县政府；国民党的县政府流亡于鹤山县沙坪；共产党则在五桂山根据地建立抗日民主政权中山县行政督导处。
日本投降后，1945年10月7日，国民党县政府从第二区谿角乡移驻石岐镇，驻学宫（今孙文中路中山市人民医院内）。随后，在全县9个区普遍设立区署，第一区驻石岐镇。
1949年12月，石岐改为区级镇。
建国后，1952年11月17日，中共粤中区委、粤中行署决定改石岐镇为石岐市，经广东省人民政府同意，1953年3月12日中央人民政府内务部批准设立石岐市（省辖市），以中山县石岐镇的行政区域为其行政区域，由粤中行署领导。
石岐建市后，分设民生、烟墩、莲峰、中区、太平、岐江上、岐江下、水上、郊区9个办事处，又从中山县划出长洲、后山、柏山、张溪、基边、员峰等6个小乡归入石岐市郊区。
1957年6月，石岐市郊区改称环城乡。
1958年8月，环城乡改为石岐市郊区公社。同年12月31日，经广东省人民委员会第二届第二次全体委员（扩大）会议通过，1959年3月22日中华人民共和国国务院批准撤销石岐市，将原石岐市的行政区城全部划归中山县。
1958年12月石岐市改为石岐公社，石岐市郊区公社并入环城公社。
1959年10月，石岐公社改为石岐镇；12月，经广东省人民委员会确定为县级镇，仍称中山县石岐镇，属中山县和佛山专区双重管辖。
1969年1月，经佛山地区革命委员会批准，石岐镇归并中山县，撤销石岐镇建制，由中山县城建街道战线管理石岐镇的工作。
1971年8月，恢复石岐镇建制（公社级）。
1983年12月22日，国务院批准撤销中山县，设立中山市（县级），以中山县的行政区域为中山市的行政区域。翌年1月10日，广东省人民政府委托佛山市代管中山市。
1984年2月，撤销石岐镇，改为中山市市区。
1988年1月7日国务院批准中山市由县级市升为地级市，由广东省人民政府管辖。
1996年9月，中山市人大常委会根据市人民政府的提请作出决议，同意将中山市城区的中区、岐江区、莲峰区、烟墩区街道办事处合并，设立中区街道办事处；同意郊区、环城区街道办事处分别更名为北区、南区街道办事处。
2000年4月，中山市人大常委会作出决议，同意撤销中区、北区街道办事处，成立石岐区街道办事处。
