秦汉时期，分属北地郡、安定郡，部分关东移民迁徙至此。
后为西夏王朝辖制腹地，多民族融合聚居。
红寺堡之名，见于有明，是明庆王就藩封地，为军事要塞，有大小烽堠24处。
1994年9月，全国政协副主席钱正英来宁考察提出开发建设扬黄灌区，解决宁南山区贫困人口脱贫问题的构想。
1995年12月国务院多次召开专题会议进行研究，正式批准宁夏扶贫扬黄灌溉工程(简称1236工程)立项，作为重点工程列入国家“九五”计划。
1998年8月正式开工建设。
1998年9月5日经宁夏自治区党委研究，于1999年1月正式挂牌成立中共红寺堡开发区工委。主要搬迁同心、海原、原州、彭阳、西吉、隆德、泾源7县（区）生活在贫困带上的贫困户，是全国最大的扶贫移民开发区。
2001年新设立红寺堡镇、
大河乡、立沙泉乡、立白墩乡、买河乡
2002年10月25日，宁夏回族自治区党委、人民政府决定，红寺堡开发区划归吴忠市管辖。
2005年上半年，红寺堡对村级组织进行改革，将原来的94个行政村合并为42个。
2009年10月28日，吴忠市红寺堡区成立，以吴忠市红寺堡镇、太阳山镇、大河乡、南川乡的行政区域为红寺堡区的行政区域，区人民政府驻红寺堡镇。
2011年宁夏回族自治区人民政府《关于吴忠市红寺堡区增设乡镇及街道办事处的批复》决定：
一、设立新民街道办事处，新设立的新民街道办事处与红寺堡镇合署办公。
二、将太阳山镇西部地域划出，设立柳泉乡，乡人民政府驻地柳泉村。
三、将南川乡更名为新庄集乡。
