1、箱式栽培
箱栽培适合于机械化的三区制（一间发菌室配两间出菇室）周年栽培。培养料的配方、堆制发酵工艺均与床架式栽培法相同。栽培箱的规格要根据机械化的程度、菇房大小及便于操作进行设计，常用的有40cm×60cm×20cm和50cm×80cm×20cm两种规格。栽培箱可用木、铝合金或硬质塑料等制作，为便于贮藏、运输和消毒灭菌，一般都制成统一规格的活动箱。把发酵并经处理的培养料装入栽培箱，料厚15cm，播上蘑菇菌种，移入发菌培养室。培养15-17天后，覆上消毒处理过的土粒，调水后再培养15～17天，此时蘑菇菌丝已基本发满培养料，移进出菇室。出菇室温度控制在（14±2）摄氏度，空气相对湿度90～95%。5～8天后蘑菇菌丝开始扭结出菇，采收约60天结束。采收结束后将箱子移到室外，倒掉废料，消毒菇室，再从发菌室移进一批已经培养好菌丝的栽培箱，降温使其出菇，周而复始地连续生产。这种箱式栽培的三区制菇房，还需要装空调等制冷设备，一般每年可种5期蘑菇。
2、畦式栽培
畦式栽培一般多利用冬闲田进行。在干稻田中，整地作畦，畦宽1.5m，高15-20cm，长则根据地形而定，在畦面上撒一层生石灰粉进行消毒。把堆制发酵成熟的培养料铺放于畦上，料厚约l0cm，整平后稍压实即可播蘑菇菌种。播种后用竹木材料做成框架，罩在菇畦上，覆盖黑色或深蓝色塑料薄膜。为了保湿和遮光，薄膜上再覆盖一层用稻草、茅草、蔗叶编织成的草帘。在栽培管理过程中，要定期掀开部分薄膜进行通风换气，并根据天气情况而定，可选在中午或下午，清晨或夜间。换气时间的长短应根据菌丝的生长量或畦上蘑菇子实体的多少，以及当天的天气情况灵活掌握。
蘑菇的箱式、畦式栽培技巧
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