[拼音]：jiazao men
[外文]：Pyrrophyta
藻类植物的1门。除少数裸型种类外，都有厚的主要是纤维素组成的细胞壁称为壳。光合色素为叶绿素 a和c，β-胡萝卜素，叶黄素类为硅甲藻素(diadinoxanthin)、甲藻黄素(dinoxanthin)、新叶黄素 (neoxanthin)及甲藻所特有的多甲藻素（peridinin）。全世界约有130属，1000多种。多数为海产种类，少数产于淡水及半咸水水体中。中国常见的淡水种类有 4个属15种，罕为共生或寄生性；温暖水域中的比寒冷水体中的多；海产种类的形态变化较大。
植物体除少数为丝状或球状类型外，绝大多数为具鞭毛的单细胞游动种类。纵裂甲藻纲的细胞壁由 2片组成，横裂甲藻纲由横沟或称腰带把细胞分成上、下两部分，上部的称为上锥部（具板片的种类或称上壳），下部的称为下锥部（具板片的种类或称下壳）。壳体或为整块，但多数系由若干多角形的板片组成，板片的数目和排列方式是分类的主要依据；在细胞腹面具与横沟垂直而向后端延伸的纵沟。鞭毛 2条，顶生或从横沟与纵沟相交处各自的鞭毛孔伸出；横鞭毛带状，环绕在横沟内，纵鞭毛线状，沿纵沟向后伸出。色素体依种类而异，呈黄绿、黄褐色。罕为蓝色，少数种类无色素体。常具蛋白核；贮藏物质为淀粉，也可产生油滴。眼点有或无。细胞核呈圆形、椭圆形或马蹄形等。染色体在细胞分裂期间呈串珠状、密集，在整个有丝分裂过程中核膜不消失，不形成纺锤体，无着丝点。细胞分裂是普遍的繁殖方法，有时也产生动孢子、不动孢子或休眠孢子。有性生殖罕见。本门大部分种类可作鱼类及水生动物的饵料。浮游种类中，特别是海产的，是水生生物食物链中的原初生产者之一；有些种类如多甲藻目中的膝沟藻在过量繁殖时形成“赤潮”，使水呈红色、淡红褐色并发出腥臭味，使水的溶氧量降低，并且分泌毒素──石房蛤毒素及其衍生物，能使其他水生生物死亡，对水产造成危害。
依照帕克和狄克逊(1976)，道奇(1982，1986)和洛布利奇(1976)的研究，甲藻门分为2纲:甲藻纲(Dinophyce-ae)和寄生的共甲藻纲(Syndinophyceae);10目：原甲藻目(Prorocentrales)，鳍藻目(Dinophysiales)，裸甲藻目(Czymnodiniales)，夜光藻目(Noctilucales)，冠甲藻目(Lophodiniales)，多甲藻目(Peridiniales)，钙甲藻目(Theracosphaerales)，囊沟藻目(Blastodiniales)，植甲藻目(Phytodinales)，丝甲藻目 (Dinotrichales)，变甲藻目(Dinamoebidales)，胶甲藻目(Gloeodiniales)，共甲藻目(Syndiniales)。