[拼音]：Junshuo
中国近代思想家章太炎的哲学论文。原为《儒术真论》的附录。写于清光绪二十五年(1899)，同年秋发表在《清议报》第28～30册上。
《菌说》的主旨是宣传进化论思想，批判宗教有神论。文中指出：宇宙万物都由原子组成。物质的“相易相生相摩，渐以化为异物”。生物是“递变”地从草木进而生蜃蛤水母，再递进“为甲节，为脊骨，复自鱼以至鸟兽而为猿、狙、猩、狒，以至为人”。文章还根据进化论思想，论证了人们的主观努力和团结奋斗对于国家、民族御侮图存具有的重要意义。
《菌说》批评了谭嗣同的《仁学》中一些宗教唯心主义观点，认为谭嗣同把以太混同于佛教的“性海”是错误的，因为以太“即传光气”，是有形的物质，其实质即是原子，与邈无倪际之“性海”有本质区别。篇中还依据生物进化论，明确地批判了神创论，说：地球上的生物和人类，不是“上帝”创造的，而是自己进化的结果。