存单纠纷具有如下特点：
1、存单纠纷中绝大部分有违法行为发生，这此违法行为是存单纠纷发生的“暗线”，特别是金融机构及其工作人员存在违反金融法规、规章的行为。
2、存单纠纷成诉少，隐患多。根据日照市金融部门统计，某市有近百万元存单存在纠纷隐患，但已诉诸法院的只有几起。其原因是存单纠纷中有大量违法行为，一旦成诉，依法处理，诉讼双方小“利益”均有受损可能，不如私了，另外，金融机构工作人员明知自己违规操作，成诉必然牵累，极力采取种种措施，力避成诉。
3、存单一般为定期存单。这些定期存单一般时间较长，比较适合于融资。
4、存款人存在追求高额利息的动机，而金融机构及其工作人员一般具有揽存的故意。
5、金融机构与用资人之间直接或间接发生资金约束。
