（一）停止形态认定
作为一种故意犯罪，妨害公务罪在理论上存在犯罪预备、犯罪中止和犯罪未遂。但是，由于妨害公务罪法定最高刑仅为3年有期徒刑，大致可眦归为轻罪范畴。因此，对于在实践中未完成形态的妨害公务行为，可以视为情节显著轻微危害不大，币以犯罪论处为宜。
（二）罪数形态认定
妨害公务罪与其他阻碍特定的国家机关_二作人员执行职务行为所构成的犯罪常常形成法条竞合关系，如妨害公务罪与抗罪，拒不执行判决、裁定罪，聚众阻碍解救被收买的妇女、儿童罪，劫夺被押解人员罪等。对此，一般适用特殊法优于普通法原则，按其他相关犯罪论处。
妨害公务罪的暴力方法导致的伤亡后果常常同时触犯故意杀人罪、故意伤害罪等其他犯罪，对此，按照想象竞合犯的处理原则，应从一重罪处断，依处罚较重的犯罪定罪量刑。
为了完成其他犯罪，妨害公务行为常常成为其他犯罪的手段行为，这样构成刑法理论上的牵连犯。对此，按照《刑法》的规定，有的需要进行数罪并罚，如《刑法》第157条第2款规定，以暴力、威胁方法抗拒缉私的，应当以走私罪和妨害公务罪进行数罪并罚；有的则只以重罪论处，如《刑法》第318条和第321条规定，在组织他人偷越国（边）境或肯运送他人偷越国（边）境过程巾，以暴力、威胁方法抗拒榆查的，以组织他人偷越围（边）境罪或者运送他人偷越国（边）境罪论处。
