11世纪以前，曾隶属于加纳。加纳衰落后，索索人一度强盛，马里又被索索人征服。
13世纪，马里强盛起来。
1235年，马里王子松迪亚塔在人民的支持下，打败索索人，随后征服加纳，建都于尼亚尼（康加巴附近），是为马里王国。松迪亚塔注意发展生产，砍伐森林，扩大耕地，种植谷物和棉花，农业、手工业和商业都有所发展。马里的粮食自给，棉织品行销国外，黄金大量运往北非。生产发展，经济繁荣，马里国家日益强大起来。
1895年沦为法国殖民地，称为“法属苏丹”。
1904年并入“法属西非”。
1956年称为“法兰西联邦”的“半自治共和国”，1958年称为”法兰西共同体”内的“自治共和国”，国内为苏丹共和国。
2012年3月22日，马里首都部分军人发动政变，杜尔政府被推翻。经西共体多轮调节，4月马里成立过渡政府，国民议会会长特拉奥雷任过渡期总统。8月，马里成立民族团结政府。12月11日，特拉奥雷总统任命迪安戈·西索科为新总理，重组政府。
2013年1月底，马里国民议会通过了过渡期路线图，明确了恢复国家统一和举行大选两项过渡期主要任务。3月，马里成立对话与和解委员会，成员33名，任期2年，旨在通过对话寻求马里各民族间的和解。
随着马里政局形势的变化，政府于2014年4月21日改组，现任总理诶穆萨·马拉。整体看来，马里经济正逐步复苏，社会发展已经进入正轨。
