枣强县迁此，已有人居住，因村东有山名苗山，曾以山名村。后为避重名，改称南苗山。
属北乡苗山保、勺山保以及常庄保。
民国初年称第六区（石马区）。
1941年春称苗山区，属莱东县。
1945年10月称苗山区、常庄区。
1951年3月，改称第九区、第十区。
1955年复称苗山区、常庄区。
1958年3月，分为龙角、苗山、常庄等乡。同年10月合并设立苗山、常庄2个公社，辖苗山、漫子、见马、铜山、勺山、常庄、文字等管理区。
1984年改称苗山办事处、常庄办事处，辖苗山、勺山、见马、铜山、漫子、常庄、文字等乡。
1985年10月，析苗山办事处为苗山镇、见马乡，析常庄办事处分为常庄乡、和庄乡。
1997年，苗山镇面积51.31平方千米，人口16654人，辖3个管理区，南苗山一、南苗山二、南苗山三、南苗山四、北苗山、北祝家洼、南祝家洼、小山前、东泉、牛旺泉、北石湾子、北辛庄、南辛庄、大漫子、小漫子、苏上坡、祝上坡、高上坡、唐上坡、上郭家沟、大后坡、小后坡、干桥、陈家店、上朱家店25个行政村，24个自然村；常庄乡面积67平方千米，人口15925人，辖6个管理区，常庄、栾家庄、东张家庄、东古德范、西古德范、南古德范、北古德范、南文字、北文字、西沟崖、上周家庄、下周家庄、东邢、西邢、磨石峪、西坡、响水湾、南峪、崮山、桃园、南围、北围、黄崖、蔡峪、邹家篮子、高塘26个行政村，26个自然村；见马乡面积92.22平方千米，人口25387人，辖4个管理区，西见马、东见马、孙家峪、宋家峪、五色崖、横山口、东杓山、西杓山、漫道、灰堆、兰子、陡峪、杓山前、北龙角、南龙角、田家楼、杨家咀、南柳子、北柳子、王家庄、王家桥、南方山、北方山、上方山、中方山、下方山、水泉峪、常家庄、石龙口、桃花峪、东孟家峪、王家胡同、铜山、下郭家沟34个行政村，46个自然村。
2000年12月，撤销常庄乡、见马乡，将其行政区域并入苗山镇。2002年，面积213.53平方千米，人口57299人，辖13个管理区，85个行政村，96个自然村。
