1990年9月，经国务院批准，成都市区划调整设立锦江、青
羊、金牛、武侯、成华等5个城区。
1991年1月1日，武侯区正式对外办公，辖小天竺、致民路、望江路、浆洗街、跳伞塔、玉林等6个城区街道办事处和桂溪、石羊场、永丰、簇桥等4个乡（分别增挂三瓦窑街道办事处、石羊场街道办事处、永丰场街道办事处、簇桥街道办事处牌子）。
1994年4月，设立肖家河街道办事处。
1995年6月，设立芳草街街道办事处。经四川省人民政府批准，1996年5月，成都高新区从武侯区划出；石羊场乡（含石羊场街道办事处）、桂溪乡（含三瓦窑街道办事处）、肖家河街道办事处和芳草街街道办事处划归成都高新区；另设立火车南站街道办事处，管辖原桂溪乡铁路以北、二环路以南区域；同时，双流县行政区划调整后的金花镇和机投镇划归武侯区管辖。
1997年6月，设立双楠街道办事处。
1999年1月，分别在金花镇和机投镇设立金花桥街道办事处、机投桥街道办事处。2000年12月设立晋阳街道办事处。
2002年6月，永丰场街道办事处更名为红牌楼街道办事处。经四川省人民政府批准，2004年8月，撤销永丰乡、簇桥乡、机投镇和金花镇的乡镇建制，实行单一的街道办事处管理体制。
2007年3月，经成都市人民政府批准，撤销小天竺、致民路两个街道办事处，将其管辖区域划归望江路、跳伞塔、玉林等3个街道办事处管辖；将原簇桥街道办事处管辖区域一分为三，分别由簇桥街道办事处和新设的簇锦街道办事处、华兴街道办事处管辖。
2010年1月对金花桥、簇桥、机投桥和华兴等4个街道办事处管辖范围�木偶艹怠⒒拧⑽牟⒘顾⑿旅纭⒙砑液印⑵呃铩追稹⑼叻俊⑺锏�10个行政村进行调整。
2014年末，武侯区辖浆洗街、望江路、火车南站、跳伞塔、玉林、双楠、红牌楼、晋阳、机投桥、簇锦、华兴、簇桥、金花桥等13个街道办事处、1个管委会，87个社区,。
