人，在住处开了一个店铺，后来人们称这小村落为“孙家铺”。由于孙家铺下面一段河道水深而缓，因此，过往船只、排筏日益增多，孙家铺也就逐渐成了竹木、粮食的集散地。客商又利用舟楫之便，将上海、南京等地的“洋油”、“洋火”、“洋布”等商品带来，促使孙家铺成为宣州以东的日杂、百货批发商业中心，靠水运发展起来的孙家铺就改为孙家埠了。清前期，孙家埠为县军事防务重地。咸丰年间，孙埠为乡辖孙埠团。据光绪十四年县志记载，已有孙埠镇之称，1932年改名永宁镇，1946年称孙埠镇。
解放初，孙埠镇属第六区辖，1950年初属第十三区，1952年7月划乡建镇，将孙埠镇划为桂仕、正兴、长河3个乡，1955年秋后，孙埠镇划为县直属镇，辖5个居委会。
1958年10月，孙埠镇和双桥、正兴、佟公3乡合并成立超美（双桥）人民公社，下辖若干生产大队。
1961年调整公社体制，超美公社分为双桥、孙埠、佟公公社。
1965年8月，设孙埠镇，孙埠公社和孙埠镇并存，1983年，孙埠公社改为孙埠乡，1984年9月，孙埠乡与镇合并称孙埠镇。2001年，区划调整后，原建国乡划为孙埠镇，驻地为孙埠镇正兴大街。全镇面积117.6平方公里，其中耕地面积53218亩，山场46257亩，属佟公坝灌区平畈地带，镇辖8个村1个社区，331个村民组，15446户，54360人。
