唐武德五年（公元622年）改宁越郡为钦州总管府，元改为钦州路，明初改为钦州府，民国年间改为钦县，属广东省钦廉专署所辖。
中华人民共和国成立后，广东省设钦廉行政专员公署，1951年改隶广西省，1955年复隶广东省
，曾一度合并到湛江专区。
1965年7月再隶广西壮族自治区，改为钦州地区行政专员公署，下辖上思、防城、钦州、灵山、浦北、合浦、北海七个县市。
1983年10月划出北海市。
1985年，防城港从防城县分出，成立自治区辖防城港管理区。
1987年7月划出合浦县归北海市管辖。
1994年6月28日，经国务院批准，撤销钦州地区，设立地级钦州市。
1994年6月28日由钦州市析出成立钦南区。
1997年1月，钦州港经济开发区成立并从钦南区析出。2001年，丽光华侨农场划入钦南区。2003年9月撤销钦城管理区，并归钦南区。
