据在萧县永堌镇出土的三叶虫化石考证，早在两亿三千多万年前，萧县境内就有生物存在。萧县有文明史6000多年，建城史3100年。
夏代，萧县是萧国都城。
春秋，复建萧国，为宋附庸。
楚，置萧邑，属楚国。
秦，置萧县，属泗水郡。此为萧县县名之始，沿用至今。
西汉，汉王元年（前206年），设萧县（治萧故城）属项羽西楚国泗水郡，高祖五年（前202年），改属韩信楚国泗水郡。设杼秋县，属彭越梁国砀郡。本始三年（前71年），宣帝封丞相韦贤为扶阳侯，建扶阳侯国（都今萧县西南30千米的岱河东岸），属沛郡。
王莽新朝，改沛郡为“吾符郡”，又作“吾府郡”，改梁国为“陈定郡”，改扶阳侯国为县，又改作“合洽县”，改杼秋县为“予秋县”。更始元年（23年），刘秀封为萧王。
东汉，今县境设萧县、杼秋县（属沛郡）、扶阳县（属砀郡）。建武十三年（37年），扶阳县改为韩歆的扶阳侯国。
三国，魏朝设萧县(属豫州)、杼秋县(属沛郡)。黄初二年（221年），封曹熊为萧公。太和三年（229年），改萧公国为萧王国（都萧故城）。
西晋，咸熙二年（265年），置萧县（曾封司马丙于此）、杼秋县，属沛国、豫州。
东晋，杼秋县在东晋乱后废，设萧县、相县属侨置沛郡。
南北朝，南朝宋置萧县、相县，属北徐州沛郡。永初三年（422年），去“
北”字，属徐州。北朝·北魏设龙城县（治龙城镇），属徐州彭城郡、萧县（治萧故城）属沛郡。南朝·梁设萧县，属睢州沛郡。北朝·东魏设萧县（治萧故城），属徐州沛郡。北朝·北齐改萧县为承高县，属徐州彭城郡。北朝·北周设承高县（萧故城）、龙城县（治龙城镇东）属徐州彭城郡。
隋，设承高县（治萧故城）、龙城县（今龙城镇），属徐州彭城郡。大定二年（583年）撤郡，直属徐州。六年，撤销龙城县，并入承高县。十八年，改承高县为临沛县。大业二年（606年），改临沛县为萧县，仍属徐州。
唐，设萧县（治萧故城），属徐州。
宋，实行路、府、（州、军）县三级制，设萧县，属京东西路徐州武宁军。绍圣年间（1094～1097年），为避黄河水患于城南半里重筑新城，世称南城，与之相对的前萧故城则称北城。
元，撤销萧县、永堌县建置，并入徐州。至元十二年复立萧县，属归德府徐州。
明，明洪武四年（1371）二月，属中都临豪府。洪武十四年十一月，属南京（南直隶）徐州。万历五年萧县南城圮于黄河决口。萧故城作为萧县政治中心退出历史舞台。朝廷批准在凤山南的阳边集（今龙城镇）创建新城，延用其东的龙城废城旧名，改称龙城。以区别故萧城，是萧县城址的第二次大迁徙，明清称萧城。
民国期间，先后称龙城市、龙城镇、城关镇。
1950年，改称龙城镇。
1958年，改称虚实人民公社。
1960年，改称萧城镇。
1980年，复称龙城镇，至今不变。
清，清顺治（1644～1661）属江南省徐州。康熙六年（1667）析
江南省为江苏、安徽两省，属江苏省徐州，雍正十一年（1733）徐州升为府，属江苏省徐州府。中华民国元年（1912年）1月，废道、府，萧县（治今龙城镇）属江苏省。
民国3年6月2日，属江苏省徐海道。废道后，萧县直属江苏省。
民国16年6月2日晨，国民革命军第三路前敌总指挥王天培部占领徐州，经萧城，进入南京国民政府江苏省控制区。
民国21年（1932年）10月10日，萧县属江苏省铜山专区又称第九专区，专员驻铜山，今徐州市区。
1938年5月18日，萧城沦陷，萧县政府解体，萧县政府为抗日民主政府取代。
1940年3～5月，国民党萧县流亡政府在七区迎风口一带活动。5月14日，驻临黄镇（今管粥集村），时称“北政府”，后据萧西地区。
1944年11月25日，伪顽合流，在临黄镇及附近的亲民村、胜利村、陆庄组建萧铜丰沛四县联防政府，并以四村镇为临时流亡县府驻地。
1946年7月18日，国民党军队占领萧城。24日，萧县政府从临黄镇迁往萧城。
1948年11月13日，中国人民解放军解放萧城，属豫皖苏第三专区。
1949年10月，属皖北行政公署宿县专区。
1953年2月，属江苏省徐州专区。
1955年4月14日，为加强洪泽湖管理，江苏省萧县、砀山与安徽省泗洪、盱眙县交换，结束了萧县从汉朝到建国前属徐州管辖的历史，属宿县专区。
1956年改属蚌埠专区。
1959年国务院决定，撤销萧县、砀山2个县，设立萧砀县。
1961年撤销萧砀县，恢复萧县、砀山县，属宿县专区。
1970年宿县专区改称宿县地区，萧县属宿县地区。
1998年12月6日，撤销宿县地区，设立地级宿州市，萧县属宿州。
