养殖方面的污染主要是工业废水、生活污水、农业废水、化肥、鱼药、养殖有机质等的污染。
1、工业废水：工业废水是各类工矿企业在生产过程中排出的生产废水、生产污水、生产废液等，这些工业废水会造成养殖水域的重金属污染、热污染、酸碱污染，放射性污染。
2、生活污水：是人类在日常生活中产生的各种生活污水，造成养殖水域的有机污染，富营养化。
3、农业废水：农业灌溉上用地下水、地表水、养殖废水并使用大量的农药、化肥等，通过土壤和降雨，经地表径流的冲刷携带进入渔业水域，造成水体富营养化和农药污染。
4、药物污染：主要是鱼病防治不当，大量乱用药物，造成养殖水体药物污染。
5、养殖引起的有机质污染：由于过多投喂优质饲料或投喂饲料系数高的劣质饲料，使养殖品种的排泄物大大超过了养殖水体的自净能力，造成养殖水体的过富营养化而成为有机质污染，使水中有机质大量积累，水质变坏、溶氧下降、病害增多、养殖品种的品质下降、死亡上升。
