栽培食用菌，原料有生料、发酵料、熟料三种处理方式。从生料到发酵料再到熟料，培养料的腐熟程度是由浅到深，营养成分的分解程度是由轻到重，杂菌基数是由多到少，但受外界杂菌的入侵程度是由难到易，从操作方面来讲是由简单到烦琐，从产量上看是由低到高，生产者应根据自己的情况，合理选择。
生料栽培生料栽培即拌料完毕后不经任何处理而直接装袋接种的栽培方式。这种栽培方式简单易行，省工省时，但接种后发菌慢，接种量大，而且在发菌过程中会造成后发酵，导致高温烧菌。在炎热的夏季，高温多雨，若栽培方法不当，易造成生料酸化腐烂以致栽培失败。因此，生料栽培仅限于菌丝生长力强的平菇、草菇等。
发酵料栽培发酵料栽培即是将原料拌匀后，按一定规格要求建堆，进入发酵工艺。当堆温达一定要求后，进行翻堆，一般要翻3～5次。通过发酵处理，可杀死培养料中的有害微生物和害虫，但操作麻烦，成本较高。平菇、草菇、双孢菇、鸡腿菇等都很适合发酵料栽培。
熟料栽培熟料栽培即要对装袋（瓶）后的培养料进行常压或高压灭菌，一方面有利于菌丝体的分解利用，另一方面可杀死培养料中的有害微生物及害虫。这种栽培方式适用于绝大多数食用菌的栽培，但需要投入大量资金购置灭菌设备和接种设备，而且对栽培技术要求较高。熟料栽培较发酵料更为节省时间，且在时间上较为主动，便于根据人力物力适时进行规模生产，且可大大减少接种量。香菇、杏鲍菇、金针菇、木耳、银耳等都必须要熟料栽培。
三种方式处理食用菌原料
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