灵芝在其生长、发育、直到来收、加工、贮藏的整个生产过程中，会受到外界环境中多种因素的影响和威胁，并面临各种生物种类的寄生、腐生、毒害、竞争和取食。由于这些因素的影响，灵芝正常的新陈代谢受到不同程度的干扰和抑制，从而降低产量；同时生理、组织、形态上产生反常症状而影响其品质，这类现象统称灵芝的病虫害。
要生产出优质高产的灵芝，菌种是关键。灵芝菌种的好坏直接影响到灵芝的栽培，菌种一旦发生病虫害，不仅使灵芝生产成本增加，延误生产日期，还会为菌种的再生产留下许多隐患。因此，菌种发生了污染，必须及时采取各种措施加以控制和防治，防止继续蔓延，污染严重的，应予以报废。为了提高灵芝的产量和品质，获得更大的经济效益，掌握菌种病虫害的防治和管理技术是非常必要的。
灵芝菌菌种常见病虫害包括：
一、根霉（rhizopus stoloifer）根霉又称旬枝根霉，黑色面包霉。
1．分类地位：根霉隶属接合菌亚门，毛霉目，根霉属。
2．形态形征：根霉菌丝无色透明，无隔膜，不长气生菌丝，只产生弧形的甸甸菌丝，称为假根，有抱子囊产生泡囊。
3．生活习性：根霉属中温喜湿性杂菌，20-25度下生长快速。
4．传播途径：主要以抱囊抱子通过空气、培养料等进行传播。
5．危害特征：
（1）根霉分布广，适应性强；
（2）根霉分解淀粉能力强，基质中呈黑色颗粒状霉层。
二、曲霉（aspergillus spp.）
1．分类地位：曲霉隶属半知菌亚门，丝孢目，曲霉属。
2．形态特征：曲霉菌丝透明，有分枝和分隔，有分生孢子梗，能产生分生孢子。曲霉颜色有多种：绿色、黑色、黄色、褐色等。
3．生活习性：适于曲霉生长的温度为20-35度，相对湿度为65%-85%之间，ph值近中性。
4．主要种类：主要有黄曲霉、黑曲霉、灰绿曲霉、烟曲霉等。
5．传播途径：曲霉主要以分生孢子通过空气传播。
6．危害特征：
（1）曲霉种类多，生长快速；
（2）它能与灵芝菌丝竞争基质营养，影响菌丝生长；
（3）曲霉能隔绝氧气，使灵芝菌丝缺氧，抑制菌丝生长；
（4）曲霉能分泌有机酸和毒素，毒杀灵芝菌丝。
三、毛霉（mucor spp.）毛霉俗称长毛霉。
1．分类地位：毛霉隶属接合菌亚门，毛霉目、毛霉属。
2．形态特征：毛霉菌丝无色透明，无横隔，菌落初期为白色，后为灰白色，淡黄色或淡褐色，气生，不产生钢甸菌丝，有孢子囊，能产生孢子囊孢子。进行有性生殖时可形成球形的接合孢子。
3．生活习性：毛霉喜高温、高湿。温度高、湿度大的情况下，通气不良时发生率很高。
4．传播途径：主要以孢囊胞子通过空气传播。
5．危害特征：
（1）毛霉分解蛋白质的能力很强，抗性强；
（2）毛霉能分泌有机酸和毒素，抑制灵芝菌丝的生长；
（3）毛霉能侵染培养基，与灵芝菌丝争夺养分与水分；
（4）毛霉种类多，且繁殖快。
四、链孢霉（neurospora spp.）链泡霉又称红色面包霉或脉孢霉、串珠霉。
1．分类地位：链孢霉隶属于子囊菌亚门，粪壳霉目，脉孢霉属。
2．形态特征：其菌丝透明，有分枝和分隔，且疏松，呈网状，无色、白色或灰色。有气生菌丝，能产生分多呈黄色或橙红色，红色。
3．主要种类：主要有橙色链孢霉、粗糙链孢霉、好食链孢霉、问型链孢霉等。
4．生活习性：链孢霉喜高温高湿，氧气充足时生长迅速。
5．传播途径：主要以分生孢子通过气流进行传播。
6．危害特征：
（1）来势猛，蔓延快，危害很大，一旦发生，难以治理，一般进行掩埋或焚烧；
（2）分生孢子萌发比其他霉菌菌丝快。
（3）气生菌丝抗性强，有力，能穿透棉塞，挤破菌袋
浅谈灵芝发菌过程中常见的病虫害
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