答：案件调查结束后，就要对案件进行综合分析，对案件性质作出正确判定，并根据认定的事实和调查情况提出案件处理建议。
（一）运用证据、综合分析
调查取证工作结束后，调查组首先要对案件的各种情况及证据进行认真的分析研究。
具体的地讲，就是根据调查取来的证据，对每个问题作出符合客观实际的结论，对每一个责任者划清责任界限。对于两个以上的责任者，要根据确凿证据，分清主要责任者、重大责任者和追随者；分清领导责任者和具体责任者，特别是决策者的责任和执行人的责任。最后形成对全案的统一认识。这一过程，实际上是一个如何使用证据材料的过程，使用证据材料要求做到：（1）对每个问题的认定，必须有可靠的证据。（2）对每个问题的认定，证据证明是什么问题，就认定是什么问题，不要人为地拔高或降低。（3）对每一个责任者，证据证明是什么责任，就认定是什么责任，不扩大、不缩小。（4）对因证据不足无法认定时，不得强行认定，必须进行补充调查，直至查清为止。
用于定案的证据必须经过查证属实。在审议中如发现案件事实不清、证据不足或手续不全的，应责成调查组补充调查。
（二）依照法律、法规准确定性。
主管领导应及时召开有调查组全体成员参加的会议，对调查材料进行讨论，在事实清楚、证据确凿的基础上，要分析认定问题的性质。认定性质要以国家法律、法规为判断的标准，对于个别一时难以确定性质的问题，可以采取写实的办法。即是什么问题，就写什么问题。如涉及技术性的问题，要请专家、行家共同研究作出技术鉴定后，再下结论。
（三）拟定案件处理建议。
对案件定性之后，要根据法律、法规的有关处罚规定拟定对案件的处理建议。提出处理建议时，要注意以下几点：
（1）拟定案件处理意见要恰当。对问题的处理要慎重，特别是涉及到对人的处理更要慎重，决不能感情用事。要依据所犯错误的事实、性质、情节、后果、本人应负的责任、认错态度及一贯表现，依据法律和法规，提出恰当的处理建议。
（2）对涉及人员多、范围广、问题复杂的案件，要与有关部门协同工作，妥善提出处理建议。
调查组应将认定的事实同被调查人见面，认真听取被调查人的申辩。如违法者无不同意见，即签署“同意”.如提出不同意见，要将他们的意见如实反映，并根据他所提供的事实证据经集体讨论研究，核实后，作出改变或不变的决定，将该结论再与违法者本人见面。对于坚持错误意见，拒不签字或表示有不同意见的要写出说明。行政机关不得因当事人申辩而加重处罚
（3）对触犯刑律或违反党纪、政纪的，在作出行政处分建议或行政处罚决定的同时，交由司法机关或党纪、政纪机关给予处罚。
（四）撰写调查报告
调查结束后，如何对案件进行分析定性？
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