民国时期，朝阳山分属平阳北港的水头、麻步和南港的灵溪管辖。民主革命时期，朝阳山是浙南苏维埃革命根据地，革命前辈陈阜、颜庆富、胡孙节、屠德川等曾在这里进行过坚苦卓绝的游击斗争，1931年冬，中共浙南委员会在朝阳山岭门头的陈阜老家成立，并相继建立了以岭门头、张者墓为中心的红军游击队根据地。
1947年，平阳县委派屠德川、胡孙节在南港区开展革命活动，以朝阳为立足点。
1948年，在中国共产党的领导下，朝阳建立了乡人民政权，是平阳县最早建立乡人民政权的革命老区之一。中华人民共和国成立后，朝阳山分置两个乡，一为朝阳乡，一为底垟乡，1957年，两乡合并为朝阳乡，随后成立朝阳人民公社，归平阳县水头区管辖。
1984年后恢复为朝阳乡。人民政府驻地原在漈头温；1990年迁至风门隔。
1992年实行撤区扩镇并乡后，成为平阳县的单列乡。2006年前设12个行政村，2007年编为7个行政村。2011年4月，根据温州大都市核心区区划调整方案，原朝阳乡行政区域并入平阳县水头镇，设立朝阳办事处。
