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1 ·Ö×ÓÉúÎïѧ¼¼Êõ

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±í 1 ΢ÉúÎïÖÖȺ½á¹¹Ñо¿²ÉÓõÄÖ÷Òª·Ö×ÓÉúÎï¼¼Êõ

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¶àÑùÐÔ·ÖÎö

DGGE/TGGE

1993 Äê G.Muyzer µÈ³õ´ÎÓ¦Óà DGGE ¼¼Êõ·ÖÎö¸´ÔÓµÄ΢ÉúÎïÖÖȺ½á¹¹

¶Ô 16SrRNA ½øÐÐÀ©ÔöԬͨ¹ý DGGE/TGGE ¶ÔÀ©Ôö²úÎï½øÐзÖÎö

Ó¦ÓÃ×îΪ¹ã·ºµÄ¼¼ÊõÖ®Ò» , ÖØÏÖÐÔÓëÁéÃô¶È²î

SSCP

1996 Äê D.H.Lee µÈÊ״βÉÓà PCR-SSCP ¼¼Êõ·ÖÎö×ÔÈ»Éú̬ϵͳµÄ΢ÉúÎï¾úȺ½á¹¹

ÀûÓà DNA µ¥Á´¹¹ÏóµÄ¶à̬ÐÔÔ¬¸ù¾Ý·Ç±äÐÔ¾Û±ûÏ©õ£°·Äý½ºµçӾʱǨÒÆÂʵIJ»Í¬À´·ÖÎö DNA µ¥Á´ÖеĻùÒòÍ»±ä

ÔÚÍ»±ä¼ì²âÉÏÓ¦Óý϶à , ΢ÉúÎïȺÂä½á¹¹½âÎöÑо¿½ÏÉÙ

RISA

1996 Äê V.G Ù¹ rtler µÈ²ÉÓà 16S-23SrDNA ¼ä¸ôƬ¶ÎÇø·ÖºÍʶ±ðϸ¾ú

ÒÔϸ¾ú 16S ºÍ 23SrDNA ¼ä¸ôƬ¶Î (ITS) ΪÑо¿¶ÔÏóÔ¬ ITS µÄ PCR À©Ôö²úÎïÓõçÓ¾·ÖÀë¿ÉÒÔ»ñµÃÌØÒìÐԵij¤¶È¶à̬ÐÔͼÆ×

ITS ³¤¶ÈµÄÌØÒìÐÔÀíÂÛÉÏ¿ÉÒÔ±íÏÖ³ö½Ï´óµÄ¶àÑùÐÔ

ARDRA

1992 Äê M.Vaneechoutte µÈ³õ´Î½¨Á¢ÁË ARDRA ·ÖÎö·½·¨

Ñ¡ÔñÐÔÀ©Ôö rDNA Ƭ¶ÎÔ¬ÔÙ¶Ô rDNA ½øÐÐÏÞÖÆÐÔøÇÐƬ¶Î³¤¶È¶à̬ÐÔ·ÖÎö¡£

¿ìËÙÓÐЧԬÓà OTUs ¶àÑùÐÔ¹À¼Æ×îµÍÏÞ¶Èϸ¾úÖÖµÄÊýÄ¿

T-RFLP

1994 Äê C.L.Moyer µÈ²ÉÓà RFLP Ñо¿É»î»ðɽ¿Ú΢ÉúÎï¶àÑùÐÔ ;1997 Äê W.T.Liu µÈÊ×ÏȽ« T-RFLP ¼¼ÊõÓÃÓÚ΢ÉúÎïȺÂä·ÖÎö

×ÛºÏ PCR ¼¼ÊõÒ¢ DNA ÏÞÖÆÐÔøÇм¼ÊõÒ¢Ó«¹â±ê¼Ç¼¼ÊõºÍ DNA ÐòÁÐ×Ô¶¯·ÖÎö¼¼ÊõÔ¬¶ÔÌض¨ºËËáƬ¶Î³¤¶È¶à̬ÐÔ½øÐвⶨ

Ö÷ÒªÓ¦ÓÃÓÚ΢ÉúÎïȺÂä×é³ÉºÍ½á¹¹Ò¢Î¢ÉúÎïϵͳ·¢Óý¼°¾úÖÖ¼ø¶¨Ñо¿

¾úÖÖ¼ø¶¨

FISH

1989 ÄêÔ¬ E.F.DeLong µÈÓÃÓ«¹â±ê¼ÇµÄ¹ÑºËÜÕËá̽ÕëÀ´Ì½²â¶ÀÁ¢µÄ΢ÉúÎïϸ°û

½«´ý²â΢ÉúÎïºËËá·Ö×Ó±äÐÔºóÔ¬ÀûÓÃÓ«¹â±ê¼ÇµÄ̽ÕëÔ¬Óëϸ°ûÄÚ¼î»ù»¥²¹Åä¶ÔÔ¬ÔÚÒ»¶¨¼¤·¢²¨³¤ÏÂÓÃÏÔ΢Êֶβⶨ΢ÉúÎïµÄ·Ö²¼ÓëÊýÁ¿

Ó¦ÓÃ×îΪ¹ã·ºµÄ¼¼ÊõÖ®Ò» , ÔÓ½»ºÍÏ´µÓ²½ÖèµÄÌõ¼þÓÅ»¯Ê®·ÖÀ§ÄÑ

16SrRNA ¿Ë¡ÎÄ¿â¼¼Êõ

1990 Äê S.J.Giovannoni µÈ³õ´Î²ÉÓÃÕë¶Ô 16SrRNA »ùÒòµÄ¿Ë¡ÎÄ¿â¼¼Êõ¶Ô SargassoSea ΢ÉúÎï½øÐзÖÎö

½«Î¢ÉúÎïϸ°û 16SrRNA ÌØÒìÀ©Ôöºó , ¶ÔºËÜÕËáÐòÁвⶨԬ²â¶¨½á¹ûÓëÒÑÖªÐòÁбȽÏÔ¬¼ø¶¨Î¢ÉúÎïÖÖÊô

Ó¦ÓÃ×îΪ¹ã·ºµÄ¼¼ÊõÖ®Ò» , ׼ȷ¶È¸ß . ÐèרҵÈËÔ±ºÍÉ豸 , ²»ÊʺϸßͨÁ¿·ÖÎö

»ùÒòоƬ¼¼Êõ

1991 Äê S.P.Fodor µÈ³õ´ÎÌá³öÉúÎïоƬԨ Biochip Ô©¸ÅÄî ;1995 Äê M.Schena µÈÓà DNA ΢ÕóÁм¼Êõ²¢Ðмì²âÄâÄϽæ¶à¸ö»ùÒòµÄ±í´ïˮƽ

×ÛºÏԭλÔÓ½»¼¼ÊõҢ΢µç×Ó¼¼Êõ¡¢¸ß·Ö×Ó»¯Ñ§ºÏ³É¼¼ÊõºÍ¼ÆËã»ú¼¼Êõ , ¶ÔÔÓ½»ÐźŵÄÇ¿¶È½øÐзÖÎö

É豸¸´ÔÓÔ¬µ«¿É¼¯³É´ò°ü´¦Àí

¶¨Á¿·ÖÎö

ʵʱ¶¨Á¿ PCR

1996 Äê C.A.Heid µÈ³õ´ÎÑз¢ÁËÒ»ÖÖʵʱ¶¨Á¿ PCR ·½·¨ , Ïà±ÈÓÚ¶¨Á¿ PCR ²Ù×÷¸ü¼Ó¼ò±ã¾«È·

ÔÚ PCR ·´Ó¦ÖмÓÈëÓ«¹â»ùÍÅԬͨ¹ý¼ì²âÓ«¹âÐźŵı仯À´¼à²â PCR À©Ôö¹ý³Ì

ºËËá¼ì²âºÍ¶¨Á¿µÄ¾«È··½·¨

×¢£º DGGE/TGGE Ϊ±äÐÔ / ζÈÌݶÈÄý½ºµçÓ¾£» SSCP Ϊµ¥Á´¹¹Ïó¶à̬ÐÔ£» RISA ΪºËÌÇÌå»ùÒò¼ä϶·ÖÎö£» ARDRA ΪÀ©ÔöÐÔ rDNA ÏÞÖÆÐÔøÇÐƬ¶Î·ÖÎö£» T-RFLP Ϊĩ¶ËÏÞÖÆøÇÐƬ¶Î³¤¶È¶à̬ÐÔ·ÖÎö£» FISH Ϊӫ¹â±ê¼ÇԭλÔÓ½»¡£

2 ·Ö×ÓÉúÎïѧ¼¼ÊõÔÚÎÛË®´¦ÀíÖеÄÓ¦ÓÃ
 
2.1 ²»Í¬ÖÖÀàÎÛË®ÔÚͬһ´¦Àí¹¤ÒÕÖеÄ΢ÉúÎïÖÖȺ±È½Ï
ÎÛË®ÖÖÀàÊǾö¶¨»îÐÔÎÛÄàÖÖȺ½á¹¹µÄÖØÒªÒòËØ¡£ÕűóµÈ²ÉÓÃDGGE¼¼Êõ¶Ô´¦ÀíÔ¡³ØÓÎÓ¾¹ÝÎÛË®¡¢Ñ§Éú¹«Ô¢ÎÛË®¡¢Ò½ÔºÎÛË®ºÍÈ˹¤ÅäË®4ÖÖÎÛË®µÄĤÉúÎï·´Ó¦Æ÷£¨MBR£©ÎÛÄàÖÖȺ½á¹¹½øÐÐÁËÑо¿£¬±È½ÏÁË×Üϸ¾úºÍ°±Ñõ»¯Ï¸¾ú£¬²¢¶ÔÓÅÊƾú½øÐÐÁË16S rDNA¿Ë¡²âÐò¡£½á¹û±íÃ÷£¬4¸öMBRÖмȴæÔÚ¹²ÓеÄ΢ÉúÎïÖÖÊô£¬µ«ÓÅÊƵØλ²¢²»Ïàͬ£¬ÓÖ´æÔÚ¸÷×Ô¶ÀÌصÄÖÖÊô£¬Í¬Ô´ÐÔ·ÖÎöÏÔʾÓÅÊÆÖÖȺÒÔProteobacteria¸ÙºÍBacillusÊôΪÖ÷£¬¶Ô°±µª½µ½âÆðÖ÷Òª×÷ÓõÄϸ¾úȺÂäÊôÓÚÏàͬµÄÖÖÊô£¬ÇÒ¶¼´¦ÓÚ¶¥¼¶µØλ£»·´Ó¦Æ÷ÖдæÔÚ×ŶàÖÖ°±Ñõ»¯¾úÊô£¬ÆäÖÐÒÔÑÇÏõ»¯µ¥°û¾úÊô×îΪÆձ飬²¢ÇÒ¼ø¶¨³ö2ÖÖ·´Ïõ»¯¾úÊô£¬¾úÂäÖк¬ÓеÄÑÇÏõ»¯¾úÊô±íÃ÷ÉúÎï´¦Àí¹ý³ÌÖк¬ÓжàÖÖÏõ»¯ºÍÍѵªÍ¾¾¶¡£N. BoonµÈʹÓÃ16S rRNA×÷ÒýÎï½áºÏDGGE ¼¼ÊõºÍͳ¼Æѧ·½·¨·ÖÎöÉú»îÎÛË®¡¢ÔìÖ½³§·ÏË®¡¢Ê³Æ·³§·ÏË®ÒÔ¼°·ÄÖ¯³§¹¤Òµ·ÏË®µÄ»îÐÔÎÛÄàÖÐ΢ÉúÎï¾úȺ½á¹¹£¬Ñо¿½á¹û±íÃ÷£¬DGGEºÍ16S rRNA¼¼Êõ²»½ö¿ÉÓÃÓڱȽÏ΢ÉúÎïȺÂä¼äµÄ²îÒ죬ͬʱҲ¿É×÷ΪһÖÖ¹¤¾ßÒÔ¸ÄÉÆÎÛË®´¦Àí¹ý³ÌÖеļà²âºÍ¿ØÖÆ£¬¸Ä½ø´¦Àí²»Í¬ÖÖÀà·ÏË®µÄ»îÐÔÎÛÄ๤ÒÕ¡£

2.2 ²»Í¬ÉúÎï´¦Àí¹¤ÒÕÖеÄ΢ÉúÎïÖÖȺÑо¿
 
2.2.1 »îÐÔÎÛÄ๤ÒÕ
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2.2.2 ÉúÎïĤ¹¤ÒÕ
ÉúÎïĤ·¨ÊÇÀûÓÃ΢ÉúÎ︽×ÅÉú³¤ÔÚÌîÁÏ»òÔØÌå±íÃ棬ÐγÉĤ״µÄ»îÐÔÎÛÄࡣФÓµÈΪÁËÑо¿´¦ÀíÀ¬»øÉøÂËÒºµÄÐòÅúʽÉúÎïĤ·´Ó¦Æ÷£¨SBBR£©ÖеÄϸ¾ú¶àÑùÐÔ£¬²ÉÓÃDGGE¼¼Êõ½øÐзÖÎö£¬¶ÔÄý½ºÈ¾É«²¢½øÐÐÌõ´øͳ¼Æ·ÖÎö¡¢Çнº²âÐò¡¢Í¬Ô´ÐÔ·ÖÎöͬʱ½¨Á¢ÁËϵͳÊ÷¡£½á¹û±íÃ÷£¬¸ÃSBBRÖÐÓжàÖÖÏõ»¯Ï¸¾úÓë·´Ïõ»¯Ï¸¾ú¡¢ºÃÑõ·´Ïõ»¯Ï¸¾úºÍÑáÑõ°±Ñõ»¯Ï¸¾ú¹²´æ£¬·´Ó¦Æ÷ÖпÉÄÜͬʱ´æÔÚÈ«³ÌÏõ»¯·´Ïõ»¯¡¢Í¬²½Ïõ»¯·´Ïõ»¯ºÍÑáÑõ°±Ñõ»¯3ÖÖÍѵª·½Ê½¡£

2.2.3 ĤÉúÎ﹤ÒÕ
ĤÉúÎï·´Ó¦Æ÷ÊÇÏÖ´úĤ·ÖÀë¼¼Êõ½áºÏ´«Í³ÉúÎï´¦Àí¼¼Êõ²úÉúµÄÒ»ÖÖ¸ßЧˮ´¦Àí¹¤ÒÕ¡£Ä²½àµÈʹÓÃPCR-DGGE¼¼Êõ¿¼²ìÁËÌì½òijÔÙÉúË®´¦Àí³§MBRµÄÅàÑøѱ»¯Ö±ÖÁÕý³£ÔËÐÐÈ«¹ý³Ìϸ¾úȺÂä½á¹¹µÄÑÝÌæÇé¿ö£¬½á¹û±íÃ÷ÔÚÕû¸öÎÛÄàѱ»¯¹ý³ÌÖУ¬Î¢ÉúÎïȺÂäÔâÊÜÁ˳å»÷£¬×îÖÕÇ÷ÓÚÎȶ¨£¬²¢ÐγÉÁËеÄÌØÓеÄ΢ÉúÎïȺÂäÉú̬ϵͳ£¬Ö¤Ã÷ÆäÖеÄÓÅÊƾúÖÖÔÚÈ¥³ýÓлúÎï¹ý³ÌÖÐÆ𵽹ؼü×÷Óá£A. C. ColeµÈ¶ÔºÃÑõĤÉúÎï·´Ó¦Æ÷£¨MABR£©Óë»îÐÔÎÛÄ๤ÒÕ½øÐÐÁ˱ȽÏÑо¿£¬½á¹û±íÃ÷MABR±È³£¹æ»îÐÔÎÛÄàϵͳÓиü·á¸»µÄ΢ÉúÎïÖÖȺ£¬ÇÒ¶ÔÓÚÈ¥³ý·ÏË®Öе嬵ª¡¢º¬Ì¼ÓлúÎïÓо޴óDZÄÜ¡£

2.2.4 ÆäËûÀàÐÍÉúÎï´¦Àí¹¤ÒÕ
Shuo FengµÈ½«amoA»ùÒòµÄT-RFLP·ÖÎöÓë¿Ë¡ºÍÐòÁзÖÎöÏà½áºÏ£¬Ñо¿ÖÐÊÔ¹æÄ£µÄ¿ÅÁ£»îÐÔÌ¿-É°×ÓË«ÖعýÂËÆ÷Öа±Ñõ»¯¹Åϸ¾úºÍ°±Ñõ»¯Ï¸¾ú»ìºÏ¾úȺµÄ¿Õ¼äÒìÖÊÐÔ¡£½á¹û±íÃ÷¿ÅÁ£»îÐÔÌ¿ÑùÆ·ÉϵݱÑõ»¯Ï¸¾ú¾úȺËæÑùÆ·ÔÚ¹ýÂËÆ÷ÖÐÉî¶ÈµÄ±ä¶¯¶ø±ä»¯¡£¶øÇÒ£¬ÑÇÏõ»¯µ¥°û¾ú¼°ÆäÀà΢ÉúÎïÊÇ¿ÅÁ£»îÐÔÌ¿ÑùÆ·ÖеÄÓÅÊÆ°±Ñõ»¯Ï¸¾ú¾úÖÖ¡£ Xiaolei LiuµÈ¶Ô´¦ÀíÖйú´«Í³Ò½Ò©¹¤Òµ·ÏË®µÄÑáÑõÕÛÁ÷·´Ó¦Æ÷£¨PABR£©ÖÐ4¸ö²»Í¬¸ô¶ÏµÄ΢ÉúÎïÖÖȺ½á¹¹½øÐÐÑо¿£¬Ñо¿·Ö3¸ö½×¶Î£ºDGGE½á¹ûÏÔʾÕý³£¸ººÉÌõ¼þÏ£¬ÔÚÓлú¸ººÉ£¨OLR£©Ôö¸ß½×¶Î£¬4¸ö¸ô¶ÏÖÐͬһȡÑùʱ¼äµÄ΢ÉúÎïÑù±¾ÖÖȺ½á¹¹²¢²»Ïàͬ£¬Í¬Ò»¸ô¶ÏÖв»Í¬È¡Ñùʱ¼äµÄ΢ÉúÎïÑù±¾ÖÖȺ½á¹¹Ò²²»Ïàͬ£»ÔÚOLRÎȶ¨½×¶Î£¬¸ô¶ÏÖеÄ΢ÉúÎïÖÖȺ½á¹¹Ç÷ÓÚÏàËÆ£»ÔÚOLR³¬¸ººÉÔËת½×¶Î£¬¸ô¶ÏÖеÄ΢ÉúÎïÖÖȺ½á¹¹±ä»¯Ó¦¶ÔË®Öʱ仯µÄ»úÄܱ»ÆÆ»µ£¬³öˮˮÖÊѸËÙ¶ñ»¯£¬Î¢ÉúÎïÖÖȺ½á¹¹ÓëÎȶ¨¶ÎÏà±È±ä»¯ÏÔÖø¡£

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2.3 ¾úÖêµÄ¼ø¶¨¼°ÔÚÉúÎïÇ¿»¯¼¼ÊõÖеÄÓ¦ÓÃ
·Ö×ÓÉúÎï¼¼Êõ¿É´Ó΢¹Û½Ç¶È¸üϸÖµØÁ˽âÎÛȾÎïµÄ½µ½â»úÖÆ¡£FISH¼¼ÊõÊÇ»îÐÔÎÛÄà¾úÖê¼ø¶¨ÖÐÓ¦ÓÃ×îΪ¹ã·ºµÄ¼¼ÊõÖ®Ò»£¬¸Ã¼¼Êõ½áºÏÏÔ΢¾µµÄ¿ÉÊÓÐÔ£¬Í¨¹ý¼¤·¢ÔÓ½»Ì½ÕëµÄÓ«¹âÀ´¼ì²âÐźţ¬´Ó¶ø¶Ôδ֪µÄºËËáÐòÁнøÐмì²â£¬½á¹û¿ÉÖ±½ÓÔÚÓ«¹âÏÔ΢¾µÏ¹۲졣S. HallinµÈ²ÉÓÃFISHºÍDGGE¼¼Êõ·ÖÎö»îÐÔÎÛÄà´¦ÀíϵͳÖа±Ñõ»¯Ï¸¾ú£¨AOB£©µÄȺÂä×é³É£¬²¢ÓÃQuantitative-FISH¶¨Á¿·ÖÎö£¬Ñо¿·¢ÏÖFISH ·¨¿ÉÈ·¶¨AOBÖÐÓëÖÖȺÊýÁ¿Ïà¹ØµÄNitrosomonas europaeaºÍNitrosomonas oligotrophaÁ½ÖÖÓÅÊƾúȺ£¬¶øDGGE·¨Ö»Äܼì²âµ½ºóÕß¡£16S rDNA¿Ë¡²âÐò¼¼ÊõÊÇÁíÒ»Öֹ㷺ʹÓõľúÖê¼ø¶¨¼¼Êõ£¬Shunni ZhuµÈ³É¹¦´Ó»îÐÔÎÛÄàÖзÖÀë³öÒ»ÖÖà­ßø½µ½â¾úÖ꣬ͨ¹ý16S rDNA²âÐò»æÖÆϵͳÊ÷£¬½âÎö³öÆä¾ßÌå¾úÊô£¬²¢Í¨¹ýʵÑé½øÒ»²½ÑéÖ¤Æä½µ½âà­ßøµÄÐÔÄÜ¡£

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3 ½áÓï
Ó봫ͳÉúÎïѧ¼¼ÊõÏà±È£¬·Ö×ÓÉúÎïѧ¼¼ÊõΪÑо¿Ë®´¦ÀíÁìÓòµÄ΢ÉúÎïÖÖȺ½á¹¹¿ª±ÙÁËÒ»ÌõȫеÄ˼·£¬Í¨¹ý¼ì²âÎÛË®ÉúÎï´¦ÀíϵͳÖеÄ΢ÉúÎïÖÖȺºËËáÐòÁжà̬ÐÔ¡¢¼ø¶¨¸öÌåµÄ»ùÒòÐÍ£¬¿ÉÒÔÁ˽âϵͳÖÐ΢ÉúÎïȺÌåµÄ¶àÑùÐÔ¡¢Êµ¼ÊÉú´æ״̬ºÍ¹¦ÄÜÌص㣬¿ÉÔÚ·Ö×ÓˮƽÉϲûÊö·ÏË®ÉúÎï´¦ÀíµÄ»úÖÆ£¬¶ÔÓÚ¸üºÃµØÓÅ»¯ÎÛË®´¦Àíϵͳ¾ßÓÐÀíÂÛÒâÒåÓëÓ¦ÓüÛÖµ¡£


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