好氧生物处理过程的生化反应方程式：
分解反应（又称氧化反应、异化代谢、分解代谢）
C、H、O、N、S + O2 CO2 + H2O + NH3 + SO42- +能量 （有机物的组成元素） 合成反应（也称合成代谢、同化作用）
C、H、O、N、S + 能量 C5H7NO2 内源呼吸（也称细胞物质的自身氧化）
C5H7NO2 + O2 CO2 + H2O + NH3 + SO42- +能量
在正常情况下，各类微生物细胞物质的成分是相对稳定的，一般可用下列实验式来表示： 细菌： C5H7NO2； 真菌： C16H17NO6； 藻类： C5H8NO2；原生动物： C7H14NO3
分解与合成的相互关系：
1） 二者不可分，而是相互依赖的；
a． 分解过程为合成提供能量和前物，而合成则给分解提供物质基础； b．分解过程是一个产能过程，合成过程则是一个耗能过程。
2) 对有机物的去除，二者都有重要贡献；
3）合成量的大小， 对于后续污泥的处理有直接影响。
不同形式的有机物被生物降解的历程也不同：
一方面：
结构简单、小分子、可溶性物质，直接进入细胞壁；
结构复杂、大分子、胶体状或颗粒状的物质，则首先被微生物吸附，随后在胞外酶的作用下被水解液化成小分子有机物，再进入细胞内。 。
另一方面：
有机物的化学结构不同，其降解过程也会不同： 
